More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0961 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  62.61 
 
 		 259 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  61.43 
 
 		 235 aa  275  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  57.59 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  53.74 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  51.72 
 
 		 262 aa  224  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  48.03 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  50 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  47.32 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  50.46 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  49.56 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  51.13 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  44.2 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  44.2 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  53.85 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  51.21 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  51.21 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  51.21 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  51.21 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  51.21 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  51.21 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  51.34 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  51.21 
 
 		 245 aa  204  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  50.72 
 
 		 245 aa  204  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  50.72 
 
 		 245 aa  204  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  51.21 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  49.56 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  49.28 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  50.88 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  45.41 
 
 		 243 aa  198  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  45.41 
 
 		 243 aa  198  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  53.97 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  48.43 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  50.47 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  44.39 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  46.34 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  44.39 
 
 		 246 aa  189  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  47.32 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  44.14 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  44.75 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  47.35 
 
 		 242 aa  185  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  48.66 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  44.89 
 
 		 222 aa  184  9e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  50 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  44.64 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  47.56 
 
 		 252 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  40.09 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  44.1 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  49.54 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  45.37 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  46.12 
 
 		 377 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  45.81 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  45.45 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  47.39 
 
 		 383 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  48.56 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  47.39 
 
 		 383 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  41.7 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  42.92 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  46.92 
 
 		 385 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  41.7 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  53.64 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  41.7 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  44.5 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  44.5 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  40 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  42.41 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  43.32 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  53.11 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  46.49 
 
 		 240 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  41.78 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  43.22 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  46.43 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  40.43 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  43.44 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  42.11 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  47.91 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  40.89 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.15 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  45.37 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  53.18 
 
 		 232 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  45.78 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  45.78 
 
 		 242 aa  168  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  45.97 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  44.61 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  40.89 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  44.84 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  41.7 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  43.3 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  44.8 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  40.99 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  43.84 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  42.48 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  43.12 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  44.25 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  45.63 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  51.13 
 
 		 268 aa  164  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  46.7 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  50.97 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  48.39 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  44.78 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>