More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0931 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  100 
 
 		 576 aa  1121    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  53.28 
 
 		 373 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  50.96 
 
 		 365 aa  302  8.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  47.95 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  50.56 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  42.4 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  46.41 
 
 		 381 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.34 
 
 		 390 aa  260  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.09 
 
 		 385 aa  256  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  42.65 
 
 		 365 aa  250  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  42.07 
 
 		 365 aa  249  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.4 
 
 		 384 aa  247  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.45 
 
 		 365 aa  242  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  38.5 
 
 		 365 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  38.27 
 
 		 365 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  37.82 
 
 		 369 aa  232  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  36.17 
 
 		 378 aa  230  5e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  44.76 
 
 		 372 aa  230  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  44.22 
 
 		 369 aa  229  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  43.91 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  39.67 
 
 		 379 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  39.67 
 
 		 379 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  39.67 
 
 		 379 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  39.67 
 
 		 379 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  41.55 
 
 		 363 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  41.55 
 
 		 364 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  41.55 
 
 		 364 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  41.55 
 
 		 364 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  41.55 
 
 		 363 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  39.67 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  44.73 
 
 		 359 aa  216  8e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  46.47 
 
 		 362 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  37.15 
 
 		 383 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  41.03 
 
 		 362 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  39.94 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  41.09 
 
 		 363 aa  213  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  41.41 
 
 		 365 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.08 
 
 		 361 aa  212  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.51 
 
 		 370 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  39.94 
 
 		 364 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  40.06 
 
 		 366 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  40.34 
 
 		 362 aa  211  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.08 
 
 		 382 aa  209  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  41.6 
 
 		 363 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  42.78 
 
 		 364 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  45.04 
 
 		 481 aa  208  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  43.19 
 
 		 365 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  42.72 
 
 		 370 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  47.16 
 
 		 356 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  45.11 
 
 		 366 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  41.38 
 
 		 362 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  40.74 
 
 		 362 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  40.74 
 
 		 362 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  44.36 
 
 		 366 aa  204  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  41.05 
 
 		 413 aa  204  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  40.8 
 
 		 362 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  39.37 
 
 		 364 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  46.8 
 
 		 369 aa  203  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.41 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  42.34 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  43.15 
 
 		 388 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  41.6 
 
 		 383 aa  200  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  45.2 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  39.37 
 
 		 364 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  39.67 
 
 		 413 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  46.1 
 
 		 356 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  39.08 
 
 		 364 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  42.62 
 
 		 357 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.11 
 
 		 349 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.18 
 
 		 353 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  38.6 
 
 		 353 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  40.23 
 
 		 364 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  39.89 
 
 		 373 aa  189  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  48.26 
 
 		 350 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  40.88 
 
 		 363 aa  187  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  40.32 
 
 		 319 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  40.06 
 
 		 393 aa  187  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  36.41 
 
 		 366 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  42.13 
 
 		 349 aa  187  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  41.23 
 
 		 376 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.27 
 
 		 369 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  43.38 
 
 		 357 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  38.74 
 
 		 381 aa  185  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  39.76 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.18 
 
 		 369 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  44.48 
 
 		 380 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  40.76 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  33.78 
 
 		 384 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.31 
 
 		 371 aa  179  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  39.6 
 
 		 376 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.01 
 
 		 363 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  40.06 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  37.64 
 
 		 371 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  38.55 
 
 		 392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1524  cobalt-precorrin-6A synthase  42.22 
 
 		 336 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00016517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  40.22 
 
 		 411 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0298  cobalt-precorrin-6A synthase  40.82 
 
 		 341 aa  173  9e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.921806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  37.43 
 
 		 421 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  34.12 
 
 		 437 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  40.49 
 
 		 368 aa  170  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>