More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0902 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  100 
 
 
309 aa  621  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  35.67 
 
 
328 aa  199  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  35.99 
 
 
328 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  36.31 
 
 
328 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 
308 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  32.22 
 
 
328 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  30.04 
 
 
322 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  29.13 
 
 
291 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30.46 
 
 
304 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  28.62 
 
 
311 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.74 
 
 
304 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  32.33 
 
 
333 aa  99.4  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.92 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  33.22 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  26.97 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  28.06 
 
 
345 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.03 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  30.43 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  28.04 
 
 
307 aa  96.3  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  30.07 
 
 
339 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.95 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  30.69 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.78 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  34.48 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  26.49 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  29.86 
 
 
330 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  29.86 
 
 
330 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  28.43 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 
322 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  31.77 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.02 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  29.39 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  29.12 
 
 
339 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  29.32 
 
 
331 aa  90.5  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.67 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  29.61 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  29.74 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  26.4 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  27.95 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  29.86 
 
 
320 aa  89.7  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  30.57 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  32.84 
 
 
337 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  28.85 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  31.77 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  28.78 
 
 
407 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  32.71 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.64 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  33.7 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  27.63 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  21.99 
 
 
338 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  29.18 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  22.88 
 
 
333 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  32.23 
 
 
360 aa  86.3  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  29.17 
 
 
328 aa  85.9  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 
290 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  24.62 
 
 
380 aa  85.9  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  27.24 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  31.09 
 
 
308 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.9 
 
 
313 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  31.42 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.39 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.63 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.63 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.63 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  31.1 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.36 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  29.89 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  27.54 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  31.1 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  30.91 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  25.95 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  32.65 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.92 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  24.64 
 
 
335 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  32.75 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  33.57 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  27.18 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  33.2 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  27.54 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  32.04 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  28.2 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  27.85 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  29.77 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  22.14 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  26.92 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  29.39 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  29.17 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  29.89 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  25.1 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.65 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  31.95 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  25.08 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  26.02 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  27.17 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>