44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0876 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 599 aa  1152    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1371  hypothetical protein  70.18 
 
 		 550 aa  200  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  35.97 
 
 		 717 aa  153  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  36.79 
 
 		 717 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  35.71 
 
 		 717 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  35.96 
 
 		 263 aa  150  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  35.96 
 
 		 263 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  35.58 
 
 		 266 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  35.58 
 
 		 266 aa  143  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  31.91 
 
 		 746 aa  140  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.6 
 
 		 283 aa  136  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.87 
 
 		 283 aa  135  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.49 
 
 		 287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  32.45 
 
 		 183 aa  94.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  32.85 
 
 		 289 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  30.06 
 
 		 255 aa  89  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  37.88 
 
 		 749 aa  87  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  31.3 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.36 
 
 		 206 aa  76.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  36.22 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  31.63 
 
 		 746 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  31.63 
 
 		 746 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  32.92 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  32.11 
 
 		 955 aa  67.8  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  30.73 
 
 		 667 aa  68.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  33.14 
 
 		 290 aa  66.6  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  34.16 
 
 		 692 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.11 
 
 		 217 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  30.34 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.13 
 
 		 970 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.63 
 
 		 970 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  29.21 
 
 		 213 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.14 
 
 		 271 aa  55.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.5 
 
 		 304 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3055  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  51.2  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0517698  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  31.97 
 
 		 314 aa  50.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.56 
 
 		 223 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5295  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1349 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  32.08 
 
 		 377 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.18 
 
 		 201 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.54 
 
 		 201 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0063  hypothetical protein  27.72 
 
 		 332 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325511 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  25.14 
 
 		 305 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  38.37 
 
 		 214 aa  44.3  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>