234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0846 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
280 aa  573  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0711  xylanase/chitin deacetylase  31.68 
 
 
315 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.485406  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  27 
 
 
290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  27 
 
 
290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  27.01 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 
319 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  33.83 
 
 
659 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  33.83 
 
 
660 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 
373 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 
659 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  27.82 
 
 
373 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
437 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  29.02 
 
 
417 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 
354 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  29.02 
 
 
417 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  29.83 
 
 
409 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 
426 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.41 
 
 
407 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
407 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  29.34 
 
 
628 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  28.99 
 
 
409 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.99 
 
 
409 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
254 aa  85.5  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  26.35 
 
 
624 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.21 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.64 
 
 
409 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  28.83 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  30.64 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  30.21 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  30.21 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.64 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 
673 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  26.47 
 
 
673 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  26.47 
 
 
673 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  26.47 
 
 
673 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  29.75 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 
510 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 
322 aa  79  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
282 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.62 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.78 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  24.41 
 
 
645 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.14 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  32.26 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 
615 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  27.11 
 
 
671 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 
615 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  26.82 
 
 
671 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  29.78 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  25.86 
 
 
724 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  27.69 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  23.6 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  23.93 
 
 
684 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  27.69 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.91 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  30.12 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  23.92 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  25.73 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.32 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  26.56 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  26.56 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 
712 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 
712 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  25.97 
 
 
672 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 
672 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  25.97 
 
 
672 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  25.97 
 
 
672 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  25.97 
 
 
672 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  25.97 
 
 
672 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0375  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0881899  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  22.54 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  25.97 
 
 
672 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  26.96 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  26.96 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  22.92 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  24.9 
 
 
640 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>