More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0712 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  100 
 
 
285 aa  573  1e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  69.12 
 
 
286 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  67.47 
 
 
288 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  62.81 
 
 
283 aa  337  2e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  40.71 
 
 
294 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  41.13 
 
 
370 aa  180  3e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.8136e-07  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  35.86 
 
 
293 aa  173  2e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3916  integrase family protein  37.19 
 
 
295 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254607  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  32.06 
 
 
283 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  36.33 
 
 
295 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  30.56 
 
 
301 aa  139  4e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.84896e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  31.54 
 
 
285 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  31.58 
 
 
304 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  5.15843e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  33.1 
 
 
295 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  35.53 
 
 
322 aa  135  6e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  30.87 
 
 
292 aa  134  1e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.12092e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  29.7 
 
 
295 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  31.8 
 
 
312 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  30.92 
 
 
304 aa  126  4e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  34.64 
 
 
304 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  32.29 
 
 
279 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.13617e-18 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  30.77 
 
 
302 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  30.45 
 
 
302 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  34.34 
 
 
294 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  30.8 
 
 
302 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  31.43 
 
 
312 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  30.96 
 
 
299 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  28.07 
 
 
297 aa  122  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.03109e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  33.47 
 
 
274 aa  122  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  31.06 
 
 
300 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  28.42 
 
 
283 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  32.51 
 
 
309 aa  120  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  8.60406e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.07 
 
 
299 aa  121  2e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  27.76 
 
 
310 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  31.18 
 
 
295 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  30.97 
 
 
296 aa  119  4e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  30.68 
 
 
309 aa  119  4e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.16 
 
 
298 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  29.17 
 
 
296 aa  119  8e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  33.33 
 
 
354 aa  119  8e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.29 
 
 
296 aa  118  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.17777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  29.74 
 
 
304 aa  118  1e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  29.79 
 
 
301 aa  118  1e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  30.94 
 
 
291 aa  117  2e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  33.71 
 
 
300 aa  117  2e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  29.17 
 
 
294 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 
305 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  30.4 
 
 
302 aa  116  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  8.94527e-13 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
296 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
296 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
296 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
296 aa  115  7e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
296 aa  115  7e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
296 aa  115  7e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
296 aa  115  7e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
296 aa  115  7e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.62 
 
 
298 aa  115  9e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3619  phage integrase family protein  36.01 
 
 
309 aa  114  1e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215155  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
296 aa  115  1e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
296 aa  115  1e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  32.13 
 
 
320 aa  114  1e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  28.06 
 
 
308 aa  114  2e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  32.47 
 
 
309 aa  114  2e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  32.75 
 
 
314 aa  114  2e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  31.01 
 
 
319 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 
315 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.58 
 
 
298 aa  113  4e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.58 
 
 
298 aa  113  4e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 
301 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.86 
 
 
300 aa  112  7e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  30.25 
 
 
313 aa  112  7e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  31.64 
 
 
310 aa  112  8e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  29.75 
 
 
305 aa  112  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.43659e-07  unclonable  2.74126e-08 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 
305 aa  111  1e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  31.21 
 
 
295 aa  111  1e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.59 
 
 
298 aa  111  1e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  31.09 
 
 
295 aa  111  1e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  27.86 
 
 
300 aa  111  1e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  29.35 
 
 
313 aa  110  2e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  9.66981e-10 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  31.23 
 
 
296 aa  110  2e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.45 
 
 
298 aa  111  2e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  32.99 
 
 
307 aa  110  2e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  30.21 
 
 
295 aa  110  2e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.58 
 
 
298 aa  110  2e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  29.37 
 
 
312 aa  110  2e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  32.71 
 
 
301 aa  111  2e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  29.58 
 
 
290 aa  111  2e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  31.76 
 
 
373 aa  111  2e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  31.82 
 
 
300 aa  110  2e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  31.67 
 
 
301 aa  111  2e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.97 
 
 
298 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  32.54 
 
 
313 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.62 
 
 
298 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  34.96 
 
 
304 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  31.82 
 
 
309 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.55 
 
 
310 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  31.44 
 
 
309 aa  109  4e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  29.93 
 
 
308 aa  110  4e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  31.44 
 
 
309 aa  110  4e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  33.45 
 
 
296 aa  110  4e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>