More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0693 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0693  zinc finger CHC2-family protein  100 
 
 		 407 aa  811    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.473403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0358  TOPRIM  46.61 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000814037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2457  TOPRIM domain protein  40.54 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000035601  unclonable  0.000000000410287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1410  hypothetical protein  41.73 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2405  hypothetical protein  34.87 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0373839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0984  TOPRIM  35.34 
 
 		 333 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  26.14 
 
 		 637 aa  97.8  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0099  hypothetical protein  26.51 
 
 		 437 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  31.56 
 
 		 655 aa  96.3  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0125  hypothetical protein  38.85 
 
 		 438 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000340794 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0156  hypothetical protein  39.49 
 
 		 437 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000439773 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0033  hypothetical protein  38.85 
 
 		 307 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  26.4 
 
 		 617 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  25.28 
 
 		 535 aa  92.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  25.97 
 
 		 640 aa  91.7  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  29.79 
 
 		 628 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  29.72 
 
 		 588 aa  91.3  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  25.84 
 
 		 579 aa  90.5  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  25.84 
 
 		 595 aa  90.1  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  29.21 
 
 		 600 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  28.42 
 
 		 584 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0995  DNA primase  26.25 
 
 		 610 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  27.76 
 
 		 584 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  29.5 
 
 		 644 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  32.9 
 
 		 588 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.57 
 
 		 599 aa  86.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  30.55 
 
 		 616 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  27.6 
 
 		 605 aa  86.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0024  zinc finger CHC2-family protein  35.67 
 
 		 200 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  28.81 
 
 		 582 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  26.98 
 
 		 581 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  29.78 
 
 		 601 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  27.73 
 
 		 606 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  30.92 
 
 		 645 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  25.33 
 
 		 646 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  25.33 
 
 		 646 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  27.7 
 
 		 584 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  25.91 
 
 		 581 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  25.91 
 
 		 581 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  26.37 
 
 		 581 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  26.37 
 
 		 581 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  26.37 
 
 		 581 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  25.37 
 
 		 602 aa  83.2  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  26.37 
 
 		 581 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  27.25 
 
 		 584 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  26.37 
 
 		 581 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  26.37 
 
 		 581 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  25.82 
 
 		 581 aa  83.2  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  27.25 
 
 		 560 aa  82.8  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  26.2 
 
 		 581 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  26.81 
 
 		 582 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  31.12 
 
 		 656 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  26.2 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  26.81 
 
 		 582 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  26.95 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  26.2 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  26.2 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  23.56 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  25.22 
 
 		 595 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  26.2 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  26.81 
 
 		 582 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  32.31 
 
 		 587 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  29.07 
 
 		 652 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  31.05 
 
 		 629 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  24.21 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  27.48 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  24.01 
 
 		 621 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  50 
 
 		 619 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  27.58 
 
 		 662 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  29.13 
 
 		 605 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  43.96 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  27.48 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  25.78 
 
 		 603 aa  80.5  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  27.48 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  27.48 
 
 		 571 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  27.48 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  27.48 
 
 		 598 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  27.48 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  27.48 
 
 		 598 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  27.48 
 
 		 598 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  45.45 
 
 		 598 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  27.99 
 
 		 599 aa  79.7  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  34.4 
 
 		 667 aa  79.7  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  26.48 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0214  DNA primase  32.47 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  23.82 
 
 		 550 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  48.84 
 
 		 578 aa  79  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  26.59 
 
 		 625 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  25.79 
 
 		 703 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  31.03 
 
 		 624 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  32.79 
 
 		 627 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  37.01 
 
 		 603 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  26.84 
 
 		 600 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  24.47 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  32.52 
 
 		 544 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  48.19 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  25.98 
 
 		 595 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  25.84 
 
 		 609 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  25.43 
 
 		 604 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  25.45 
 
 		 656 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>