More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0660 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 464 aa  927    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.47 
 
 		 483 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.47 
 
 		 497 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.87 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  59.06 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.02 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.78 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  54.53 
 
 		 460 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.11 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  53.91 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  55 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.54 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.31 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.57 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.01 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.14 
 
 		 465 aa  364  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.75 
 
 		 459 aa  348  9e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.79 
 
 		 462 aa  348  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.01 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  40.17 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  40.17 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  44.15 
 
 		 475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.7 
 
 		 491 aa  337  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.43 
 
 		 462 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.79 
 
 		 480 aa  333  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  39.14 
 
 		 480 aa  329  7e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  42.23 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.23 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.96 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  42.76 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.38 
 
 		 479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  41.58 
 
 		 483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.79 
 
 		 479 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  38.71 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  42.15 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  42.02 
 
 		 480 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.74 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  41 
 
 		 481 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  41.57 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.94 
 
 		 482 aa  320  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  38.33 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.21 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  40.17 
 
 		 497 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  39.96 
 
 		 497 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.01 
 
 		 490 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.72 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.51 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  40 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.45 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.72 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  40.79 
 
 		 479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  40.04 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.51 
 
 		 482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  42.06 
 
 		 481 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.38 
 
 		 462 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  40.43 
 
 		 485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.65 
 
 		 485 aa  313  4.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.62 
 
 		 477 aa  313  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  41.35 
 
 		 480 aa  313  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.3 
 
 		 480 aa  312  9e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.17 
 
 		 486 aa  312  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.84 
 
 		 480 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.36 
 
 		 493 aa  309  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  40.35 
 
 		 482 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.96 
 
 		 489 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.82 
 
 		 486 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.56 
 
 		 482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  40.82 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.82 
 
 		 486 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  39.14 
 
 		 481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  38.96 
 
 		 481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.72 
 
 		 459 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  41.53 
 
 		 481 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.53 
 
 		 481 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  38.54 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  39.22 
 
 		 481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  40.3 
 
 		 482 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  42.06 
 
 		 481 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  39.57 
 
 		 477 aa  304  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.53 
 
 		 482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  39.87 
 
 		 477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  38.71 
 
 		 481 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  39.64 
 
 		 471 aa  303  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  38.01 
 
 		 491 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  38.58 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  39.39 
 
 		 481 aa  299  6e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  39.56 
 
 		 481 aa  299  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.06 
 
 		 475 aa  299  8e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.06 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.7 
 
 		 488 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  37.96 
 
 		 481 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  40.21 
 
 		 488 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  37.96 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  37.96 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  39.18 
 
 		 481 aa  296  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.92 
 
 		 464 aa  296  7e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.06 
 
 		 490 aa  295  8e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  38.49 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  38.96 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>