More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0658 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  100 
 
 		 178 aa  353  8.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0989  shikimate kinase  61.05 
 
 		 189 aa  204  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.764928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  50.56 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  56.21 
 
 		 173 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  49.4 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  52.47 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  41.76 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  45.06 
 
 		 172 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  45.83 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  43.53 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  40 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  41.92 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  38.89 
 
 		 552 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  38.92 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  38.79 
 
 		 591 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  40.61 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  39.52 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  38.15 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  42.26 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  38.55 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  38.64 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  40.12 
 
 		 462 aa  112  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  36.14 
 
 		 198 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 		 594 aa  111  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1516  shikimate kinase  35.48 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.681098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  40.12 
 
 		 190 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  36.36 
 
 		 198 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  43.92 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  39.62 
 
 		 454 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  38.69 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  36.59 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  37.28 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  37.28 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  40 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  37.28 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  36.84 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  38.01 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  37.95 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  39.87 
 
 		 209 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  37.65 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  37.01 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  38.69 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  37.65 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  39.87 
 
 		 199 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  37.97 
 
 		 197 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  38.69 
 
 		 193 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  39.87 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  41.83 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  39.87 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  39.87 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  37.72 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  38.6 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  39.87 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  41.18 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  39.87 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0960  shikimate kinase  34.25 
 
 		 199 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  39.87 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  37.87 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  39.87 
 
 		 181 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  41.32 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  37.28 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  37.87 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  36.05 
 
 		 229 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  38.12 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1297  shikimate 5-dehydrogenase  43.86 
 
 		 458 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  39.88 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  37.06 
 
 		 185 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  41.21 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38.22 
 
 		 593 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  40.52 
 
 		 183 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  41.18 
 
 		 184 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  40.52 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  41.18 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  36.09 
 
 		 165 aa  104  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  37.28 
 
 		 190 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  38.27 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  38.92 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4020  shikimate kinase  37.13 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263055  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  38.06 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  38.41 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  35.98 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  37.35 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  36.08 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  38.18 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  36.26 
 
 		 216 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  38.46 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  35.44 
 
 		 185 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  38.46 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  37.58 
 
 		 195 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  40.74 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  34.36 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  37.58 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  36.26 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  40.13 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  44.3 
 
 		 615 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0371  shikimate kinase  41.78 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  36.36 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  37.21 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0909  shikimate kinase  39.6 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2715  shikimate kinase  41.78 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0246166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>