More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0616 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
373 aa  768    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  37.45 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 
347 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
278 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 
296 aa  132  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 
659 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 
660 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 
659 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  32.59 
 
 
640 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  30.64 
 
 
712 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  30.64 
 
 
712 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
673 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  33.33 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 
262 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  29.24 
 
 
298 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 
628 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  27.64 
 
 
624 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 
370 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.48 
 
 
258 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  28.09 
 
 
724 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 
254 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  32.49 
 
 
671 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 
264 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 
282 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  30.26 
 
 
672 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 
349 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  30.26 
 
 
672 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 
672 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  30.26 
 
 
672 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  30.26 
 
 
672 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
284 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  30.26 
 
 
672 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  28.68 
 
 
684 aa  109  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  28.57 
 
 
284 aa  109  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  28.26 
 
 
673 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  30.26 
 
 
672 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  28.26 
 
 
673 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  28.26 
 
 
673 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  28.39 
 
 
665 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 
274 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  28.16 
 
 
671 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 
695 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 
280 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 
278 aa  106  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  30.48 
 
 
256 aa  106  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 
297 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 
697 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
548 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 
697 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  27.63 
 
 
273 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 
255 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
263 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 
698 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
263 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  27.89 
 
 
273 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 
697 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
548 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  27.89 
 
 
273 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 
457 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  27.89 
 
 
273 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 
697 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 
321 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  29.41 
 
 
273 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 
645 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.39 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  28.81 
 
 
273 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  28.81 
 
 
273 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.96 
 
 
306 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  28.81 
 
 
273 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  25.82 
 
 
266 aa  96.7  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 
279 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  27.91 
 
 
354 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 
697 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 
276 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  40.83 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0711  xylanase/chitin deacetylase  32.63 
 
 
315 aa  94  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.485406  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  24.9 
 
 
256 aa  94  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 
273 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  27.06 
 
 
273 aa  92.8  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  25.7 
 
 
336 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  30 
 
 
409 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 
285 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 
319 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  33.51 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 
224 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 
276 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  27.39 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  29.55 
 
 
409 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  25.84 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  26.25 
 
 
264 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.55 
 
 
407 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  31.25 
 
 
261 aa  89.4  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 
348 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 
295 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 
348 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>