More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0606 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  100 
 
 
210 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  47.5 
 
 
194 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  45.64 
 
 
192 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  42.59 
 
 
225 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  43.75 
 
 
204 aa  134  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  42.04 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  36.32 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  45.39 
 
 
195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  42.21 
 
 
213 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 
198 aa  121  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 
192 aa  121  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  37.11 
 
 
188 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  37.11 
 
 
188 aa  121  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  37.11 
 
 
188 aa  121  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  37.11 
 
 
188 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  37.11 
 
 
188 aa  121  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  37.11 
 
 
188 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  37.11 
 
 
188 aa  121  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  37.17 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  44.83 
 
 
172 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  41.1 
 
 
208 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  44.83 
 
 
172 aa  118  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  43.33 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  40.13 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  44.97 
 
 
162 aa  116  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  37.16 
 
 
204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  37.36 
 
 
231 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  39.49 
 
 
226 aa  109  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  34.52 
 
 
225 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  39.87 
 
 
207 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  40.13 
 
 
174 aa  109  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  37.82 
 
 
204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  38.04 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  40.25 
 
 
175 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  42.38 
 
 
202 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36.52 
 
 
190 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  37.24 
 
 
238 aa  107  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  38.33 
 
 
181 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  39.86 
 
 
178 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 
208 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  34.3 
 
 
239 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 
208 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  40.12 
 
 
178 aa  105  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  44.29 
 
 
208 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  35.62 
 
 
274 aa  105  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  41.22 
 
 
189 aa  104  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.18 
 
 
282 aa  104  8e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  37.68 
 
 
224 aa  104  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  37.64 
 
 
248 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  41.79 
 
 
199 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 
239 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  32.56 
 
 
239 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  32.96 
 
 
206 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  31.35 
 
 
210 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 
207 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  34.87 
 
 
195 aa  102  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1243  GrpE protein  37.57 
 
 
194 aa  102  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.847683  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.14 
 
 
248 aa  101  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  31.98 
 
 
223 aa  101  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 
198 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  36.2 
 
 
181 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  39.04 
 
 
156 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 
211 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  37.33 
 
 
189 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  34.67 
 
 
181 aa  99.8  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  32.97 
 
 
187 aa  98.6  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  35.51 
 
 
181 aa  98.6  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  35.56 
 
 
198 aa  98.2  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  33.86 
 
 
189 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.5 
 
 
243 aa  98.6  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  37.57 
 
 
187 aa  98.2  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  31.15 
 
 
187 aa  98.2  9e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  38.81 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  26.58 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  36.31 
 
 
261 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  36.31 
 
 
261 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.35 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  34.27 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  39.47 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  33.55 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  34.48 
 
 
187 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  33.56 
 
 
247 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  36.09 
 
 
186 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  37.42 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  35.86 
 
 
191 aa  95.1  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  32.05 
 
 
217 aa  94.7  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  34.43 
 
 
187 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 
195 aa  94  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  33.51 
 
 
246 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  35.09 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  31.55 
 
 
259 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  35.2 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  33.51 
 
 
215 aa  94  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  33.75 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  37.65 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  33.56 
 
 
259 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  33.73 
 
 
172 aa  92.8  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  29.55 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  32.72 
 
 
190 aa  92.4  5e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  32.22 
 
 
200 aa  92.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>