249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0604 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
343 aa  694    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.2 
 
 
344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.67 
 
 
347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  48.55 
 
 
345 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.35 
 
 
344 aa  289  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.59 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.39 
 
 
351 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  36.13 
 
 
344 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  37.61 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.39 
 
 
348 aa  239  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  36.84 
 
 
338 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  36.44 
 
 
343 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.44 
 
 
343 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  35.48 
 
 
338 aa  235  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.61 
 
 
343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  35.48 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  35.48 
 
 
338 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  35.48 
 
 
338 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  35.48 
 
 
338 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  35.48 
 
 
338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  35.48 
 
 
338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  35.48 
 
 
338 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  35.78 
 
 
338 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.12 
 
 
341 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  36.05 
 
 
339 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.06 
 
 
342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.25 
 
 
357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.67 
 
 
343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  36.05 
 
 
339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.75 
 
 
343 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.88 
 
 
344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.81 
 
 
343 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.15 
 
 
343 aa  212  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 
345 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.06 
 
 
343 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.36 
 
 
343 aa  202  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.03 
 
 
344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  32.46 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 
343 aa  193  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.28 
 
 
348 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  34.31 
 
 
352 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.29 
 
 
352 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 
347 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.1 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  36.67 
 
 
364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 
359 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  33.03 
 
 
367 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0620  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.23 
 
 
337 aa  180  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.8 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  32.74 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  36.39 
 
 
360 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  33.71 
 
 
360 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  36.39 
 
 
360 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  34.41 
 
 
336 aa  179  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  32.74 
 
 
349 aa  179  7e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  32.94 
 
 
343 aa  179  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 
342 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.55 
 
 
365 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2657  heat-inducible transcription repressor  33.92 
 
 
350 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44913  normal  0.911216 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.58 
 
 
340 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.58 
 
 
340 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  28.98 
 
 
352 aa  175  9e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.06 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  34.01 
 
 
354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.85 
 
 
357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  32.55 
 
 
339 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 
342 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.79 
 
 
354 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  35.46 
 
 
370 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  35.47 
 
 
340 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.73 
 
 
351 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  34.48 
 
 
365 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.62 
 
 
337 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  35.47 
 
 
351 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  33.84 
 
 
338 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.49 
 
 
337 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.83 
 
 
355 aa  168  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.06 
 
 
344 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  34.23 
 
 
343 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1220  heat-inducible transcription repressor  32.16 
 
 
356 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  31.87 
 
 
334 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.37 
 
 
338 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  30.9 
 
 
339 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.82 
 
 
340 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2881  heat-inducible transcription repressor  32.16 
 
 
346 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  31.96 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  32.74 
 
 
372 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.28 
 
 
355 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  32.74 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  32.67 
 
 
362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  31.78 
 
 
341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  30.9 
 
 
339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.46 
 
 
354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  31.91 
 
 
367 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
350 aa  165  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  33.02 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  31.87 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  31.09 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  31.09 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>