More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0548 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  100 
 
 		 368 aa  733    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  54.99 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  48.19 
 
 		 411 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  47.91 
 
 		 411 aa  358  6e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  47.91 
 
 		 411 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  46.8 
 
 		 407 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  47.4 
 
 		 369 aa  339  4e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  45.11 
 
 		 408 aa  337  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  46.3 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  45.6 
 
 		 386 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  43.75 
 
 		 371 aa  330  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  46.67 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  45.58 
 
 		 390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  45.88 
 
 		 388 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  44.41 
 
 		 387 aa  318  7e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  43.17 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  44.69 
 
 		 370 aa  315  5e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  41.76 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  44.17 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  43.02 
 
 		 384 aa  301  9e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  45.33 
 
 		 388 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  41.32 
 
 		 411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  38.48 
 
 		 408 aa  280  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  39 
 
 		 396 aa  279  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  39.29 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  38.72 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  38.89 
 
 		 408 aa  275  8e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  39.29 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  41.3 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  36.22 
 
 		 397 aa  196  7e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  36.21 
 
 		 398 aa  189  8e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  36 
 
 		 398 aa  186  4e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  30.48 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  31.06 
 
 		 463 aa  169  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  30.08 
 
 		 475 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  28.76 
 
 		 441 aa  167  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  30.65 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  30.38 
 
 		 464 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  30.39 
 
 		 467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  31.09 
 
 		 470 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  29.46 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  29.33 
 
 		 476 aa  159  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  29.79 
 
 		 472 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.84 
 
 		 482 aa  156  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  29.95 
 
 		 470 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  29.6 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  28.61 
 
 		 466 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  30.38 
 
 		 485 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  27.59 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  29.61 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  31.07 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  30.42 
 
 		 465 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  29.37 
 
 		 476 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  29.33 
 
 		 471 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  29.24 
 
 		 472 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  28.99 
 
 		 472 aa  151  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  29.82 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  28.04 
 
 		 476 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  29.44 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  29.76 
 
 		 481 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  28.76 
 
 		 476 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  30.29 
 
 		 487 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  30.38 
 
 		 487 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  28.8 
 
 		 472 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  29.89 
 
 		 465 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.33 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  27.93 
 
 		 483 aa  148  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  29.56 
 
 		 471 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.76 
 
 		 490 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  29.14 
 
 		 465 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  28.19 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  29.22 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  29.37 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  29.37 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  29.37 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  29.37 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  29.49 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  29.37 
 
 		 463 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  29.37 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  29.37 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  29.79 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  29.26 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  29.26 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  29.1 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  29.14 
 
 		 473 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  30.03 
 
 		 468 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.61 
 
 		 469 aa  146  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  28.99 
 
 		 470 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.3 
 
 		 483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  29.03 
 
 		 481 aa  145  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  29.03 
 
 		 479 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  28.84 
 
 		 480 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  29.97 
 
 		 485 aa  145  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  29.33 
 
 		 470 aa  145  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  29.1 
 
 		 465 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  28.61 
 
 		 487 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1745  FeS assembly protein SufB  28.12 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  28.61 
 
 		 487 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  28.69 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  28.61 
 
 		 487 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>