25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0500 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 135 aa  268  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  50.93 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  48.15 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  50.85 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  32.48 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  39.62 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  38.81 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  33.71 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  39.71 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  38.55 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  30.84 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  37.65 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2490  DNA polymerase beta domain protein region  28.89 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  26.26 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0988  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0677901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  26.5 
 
 		 304 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  30.1 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  30.84 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>