More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0479 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  100 
 
 		 265 aa  528  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  52.4 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  47.86 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  44.91 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  45.02 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  46.99 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  41.96 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  42.57 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  41.83 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  42.57 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  46.53 
 
 		 289 aa  218  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  39.92 
 
 		 267 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  45.45 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  44.13 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  46.51 
 
 		 281 aa  215  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  43.72 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  44.27 
 
 		 266 aa  214  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  46.15 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  43.95 
 
 		 278 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  41.92 
 
 		 276 aa  211  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  41.37 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  42.57 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  41.51 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  44.35 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  45.97 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  40.55 
 
 		 264 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  45.19 
 
 		 284 aa  208  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  41.37 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  41.34 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  40.89 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  42.86 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  41.92 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  41.37 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  41.6 
 
 		 265 aa  199  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  41.5 
 
 		 275 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  41.5 
 
 		 275 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  41.63 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  42.35 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  37.55 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  42.91 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  43.07 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  42.57 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  42.47 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  35.85 
 
 		 283 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  37.65 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  39.2 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  38.37 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  38.37 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  38.37 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  38.37 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  38.37 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  38.37 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  37.55 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  38.37 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  38.37 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  38.15 
 
 		 307 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  38.37 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  36.51 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  42.28 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  42.41 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  42.69 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  42.69 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  37.85 
 
 		 271 aa  188  9e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  42.91 
 
 		 270 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  38.57 
 
 		 303 aa  186  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  40.24 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  39.75 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  40.3 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  38.67 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  39.43 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  41.7 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  41.27 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  35.88 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  40.94 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  43.02 
 
 		 292 aa  185  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  41.39 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  40.08 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  39.43 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  39.75 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  39.43 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  40.23 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  39.43 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  42.31 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  40.39 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  40.65 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  40.16 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  38.22 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  40 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  39.36 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  39.76 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  41.76 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  36.95 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  39.22 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  39.67 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  42.57 
 
 		 271 aa  181  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  39.27 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  42.52 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  40 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  40.08 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  39.53 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>