70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0452 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  100 
 
 
603 aa  1180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  28.74 
 
 
603 aa  266  6e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0823  hypothetical protein  32.77 
 
 
691 aa  258  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00604121  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0394  hypothetical protein  33.65 
 
 
543 aa  257  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000249945  normal  0.153411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0429  hypothetical protein  30.59 
 
 
574 aa  202  1e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4099  protein of unknown function DUF342  27.6 
 
 
598 aa  147  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.08473e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  32.23 
 
 
611 aa  113  1e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  36.36 
 
 
546 aa  113  1e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  28.92 
 
 
622 aa  112  2e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  5.79847e-05  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  31.27 
 
 
542 aa  111  4e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  30.58 
 
 
563 aa  107  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  29.66 
 
 
563 aa  107  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  27.96 
 
 
530 aa  106  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  36.75 
 
 
534 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  28.8 
 
 
563 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  28.8 
 
 
563 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  37.13 
 
 
562 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  37.13 
 
 
562 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04321e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  37.13 
 
 
562 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  37.13 
 
 
562 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  30.82 
 
 
556 aa  104  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  30.8 
 
 
660 aa  103  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.13292e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  35.59 
 
 
562 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  30.1 
 
 
555 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  28.77 
 
 
467 aa  99.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  32 
 
 
562 aa  98.6  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  34.86 
 
 
565 aa  94.7  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  29.88 
 
 
501 aa  94.7  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  33.5 
 
 
463 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  30.04 
 
 
530 aa  92.8  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  30.57 
 
 
462 aa  91.3  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  27.31 
 
 
459 aa  90.5  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.75912e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  29.92 
 
 
527 aa  90.5  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  34.02 
 
 
555 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  33.18 
 
 
546 aa  87  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  36.77 
 
 
556 aa  87.4  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  29.95 
 
 
532 aa  86.3  1e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  32.98 
 
 
556 aa  86.3  1e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  26.24 
 
 
656 aa  85.5  2e-15  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  31.73 
 
 
461 aa  85.5  3e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  30.73 
 
 
554 aa  84  7e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  26.47 
 
 
462 aa  83.6  9e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  25.19 
 
 
529 aa  83.6  1e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  30.14 
 
 
544 aa  83.2  1e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  3.93022e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  28.85 
 
 
556 aa  82.8  2e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  29.49 
 
 
545 aa  80.5  8e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  32.22 
 
 
556 aa  79.7  1e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  26.5 
 
 
484 aa  79.3  2e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  29.67 
 
 
455 aa  77.4  7e-13  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  29.3 
 
 
455 aa  77  1e-12  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000996  predicted polymerase  26.86 
 
 
559 aa  76.6  1e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717686  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07053  hypothetical protein  27.88 
 
 
566 aa  77  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  30.36 
 
 
547 aa  74.7  4e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  37.36 
 
 
541 aa  74.7  5e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  27.35 
 
 
552 aa  73.2  1e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  33.33 
 
 
538 aa  72  3e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  30.52 
 
 
653 aa  70.5  1e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  23.59 
 
 
467 aa  67.8  5e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  23.44 
 
 
525 aa  67.4  8e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  30.64 
 
 
629 aa  65.9  2e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  30.59 
 
 
562 aa  65.1  3e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  25.79 
 
 
551 aa  63.9  8e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  27.01 
 
 
509 aa  63.5  1e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  27.06 
 
 
520 aa  63.5  1e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  29.14 
 
 
371 aa  58.5  3e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  25.31 
 
 
456 aa  57.8  6e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  29.73 
 
 
378 aa  51.6  4e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  27.1 
 
 
381 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  42.37 
 
 
578 aa  43.9  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  21.11 
 
 
728 aa  43.9  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>