More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0423 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 403 aa  828    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  57.07 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  57.66 
 
 		 392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  52.56 
 
 		 392 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  56.96 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  56.4 
 
 		 398 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  56.4 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  54.47 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  55.06 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  54.74 
 
 		 384 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  55.47 
 
 		 393 aa  431  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  55.26 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  53.77 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  52.79 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  53.37 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  54.74 
 
 		 399 aa  427  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  53.85 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  54.59 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  53.08 
 
 		 409 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  54.33 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  53.91 
 
 		 396 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  53.61 
 
 		 396 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  50.91 
 
 		 406 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50.77 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  54.64 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  55.47 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  55.41 
 
 		 392 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  49.61 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  53.59 
 
 		 395 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  52.08 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  52.08 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  50.52 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  48.95 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  47.64 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0756  aminotransferase class V  49.61 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000203791  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  48.25 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  48.69 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  49.07 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  49.21 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  46.98 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  46.88 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.26 
 
 		 389 aa  360  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.94 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  46.75 
 
 		 400 aa  355  8.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  46.83 
 
 		 395 aa  354  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.24 
 
 		 398 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  47.37 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  46.61 
 
 		 399 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  47.14 
 
 		 386 aa  352  5e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  47.04 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  46.84 
 
 		 401 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  46.28 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  50 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 404 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  47.37 
 
 		 384 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 404 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  47.92 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  47.92 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  47.66 
 
 		 403 aa  345  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  46.41 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  45.79 
 
 		 401 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  45.26 
 
 		 389 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  45.79 
 
 		 401 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  43.95 
 
 		 402 aa  343  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  44.74 
 
 		 389 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  45.53 
 
 		 400 aa  342  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  46.4 
 
 		 381 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  47.14 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  47.4 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  44.9 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  45.57 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  44.74 
 
 		 389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  48.14 
 
 		 385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  46.07 
 
 		 389 aa  340  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  46.35 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  48.16 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  44.9 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  44.9 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  44.9 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  45.83 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  45.57 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  44.9 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  44.9 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  45.36 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  45.57 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  44.9 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  45.57 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  44.9 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  45.57 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  44.9 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  44.9 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  45.83 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  44.5 
 
 		 393 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  45.57 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  45.83 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  44.85 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  47.11 
 
 		 388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  46.09 
 
 		 407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>