More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0422 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  72.73 
 
 		 173 aa  187  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  68.29 
 
 		 125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  65.57 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  61.42 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  65.29 
 
 		 123 aa  172  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  62.7 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65.81 
 
 		 124 aa  168  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  58.54 
 
 		 129 aa  167  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.29 
 
 		 127 aa  166  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  58.91 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.84 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  62.5 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  60.33 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.5 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  57.66 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  57.38 
 
 		 139 aa  159  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.41 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  60.68 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.92 
 
 		 153 aa  150  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  59.83 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  64.75 
 
 		 125 aa  149  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.55 
 
 		 142 aa  149  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  54.55 
 
 		 144 aa  149  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.35 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  55 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.03 
 
 		 124 aa  146  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.78 
 
 		 286 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  58.06 
 
 		 207 aa  142  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.24 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  52.14 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0951  NifU domain-containing protein  50.83 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.08 
 
 		 284 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  50.38 
 
 		 163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.08 
 
 		 284 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.03 
 
 		 281 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  49.19 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  58.54 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  52.54 
 
 		 291 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.54 
 
 		 291 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.14 
 
 		 283 aa  133  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.23 
 
 		 280 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  47.93 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.85 
 
 		 309 aa  130  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  53.72 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  46.22 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.33 
 
 		 277 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  54.24 
 
 		 211 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.43 
 
 		 278 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.93 
 
 		 288 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.85 
 
 		 281 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 		 284 aa  127  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.08 
 
 		 290 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  55.93 
 
 		 285 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.34 
 
 		 281 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.93 
 
 		 286 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.26 
 
 		 276 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  48.31 
 
 		 312 aa  124  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  53.39 
 
 		 211 aa  124  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.62 
 
 		 298 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  51.22 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  51.16 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.19 
 
 		 300 aa  120  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  47.29 
 
 		 182 aa  120  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.8 
 
 		 296 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  50.79 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.79 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  50 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  48.82 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.82 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  48.82 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.46 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  48.82 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  48.87 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  50.83 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  48.82 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  50 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.77 
 
 		 306 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  48.82 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  48.82 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  50 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  48.82 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  48.82 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  41.67 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.82 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  50 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  48.03 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  50.79 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  48.03 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  48.03 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  48.03 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  48.03 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  48.03 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.19 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  48.85 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  48.06 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  48.06 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  48.06 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>