22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0408 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0408  thiamineS protein  100 
 
 
106 aa  207  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1954  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2272  hypothetical protein  47.13 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0378  hypothetical protein  48.28 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1649  hypothetical protein  41.24 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00308547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2429  hypothetical protein  42.22 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0150509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2502  thiamineS protein  44.19 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00382478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3287  hypothetical protein  39.02 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0070  hypothetical protein  39.77 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0973  hypothetical protein  39.02 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1701  thiamineS protein  41.11 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00127323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2870  hypothetical protein  37.21 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0617124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  41.33 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  37.33 
 
 
78 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  34.67 
 
 
79 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  40 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  33.78 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  28.4 
 
 
251 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  28.21 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  33.96 
 
 
251 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  40.43 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  26.67 
 
 
254 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>