More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0405 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  53.59 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  45 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.83 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.45 
 
 		 246 aa  208  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  43.93 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  43.93 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.02 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  42.32 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  43.39 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  41.37 
 
 		 277 aa  198  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.06 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  43.15 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.63 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.5 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.55 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.06 
 
 		 292 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.06 
 
 		 292 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  39.33 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  41.08 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  46.31 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.98 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.28 
 
 		 327 aa  188  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.08 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  40.66 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  40.66 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  40.66 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  40.66 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.66 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  40.66 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.66 
 
 		 247 aa  187  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.66 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.04 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  40.96 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.33 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  40.98 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.22 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  42.56 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.84 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.66 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  39.84 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  41.6 
 
 		 242 aa  178  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  40.96 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  40.25 
 
 		 323 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  42.11 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.87 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  39 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.67 
 
 		 416 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.58 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  43.03 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.67 
 
 		 442 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2119  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.4 
 
 		 519 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42 
 
 		 322 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  41.3 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  44.26 
 
 		 373 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03790  rRNA methylase, putative, group 3  37.4 
 
 		 300 aa  171  7.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000601463  normal  0.201311 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.74 
 
 		 542 aa  171  9e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  34.44 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.03 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  34.44 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.25 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.19 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4924  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.98 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2929  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.1 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0728  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.66 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  44.21 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.74 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  41.2 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.15 
 
 		 327 aa  168  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  39.24 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.74 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  43.98 
 
 		 372 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0372  RNA methyltransferase  44.58 
 
 		 386 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176167  hitchhiker  0.00238073 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.32 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  40.89 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  38.37 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.74 
 
 		 652 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  42.91 
 
 		 536 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  42.5 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  39.24 
 
 		 251 aa  165  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  41.08 
 
 		 245 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.75 
 
 		 324 aa  164  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0856  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.13 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  39.27 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  38.72 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.44 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2661  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.63 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.24 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107399  normal  0.310165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  41.39 
 
 		 312 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.16 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0306  TrmH family tRNA methyltransferase  37.55 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.16 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13612  tRNA/rRNA methyltransferase  41.74 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.288349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.92 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0731  RNA methyltransferase  40.96 
 
 		 328 aa  161  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0672  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.63 
 
 		 333 aa  160  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.927716  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1580  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.28 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.76 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  34.03 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  38.31 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>