More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0403 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
474 aa  969    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 
478 aa  630  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 
500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 
486 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 
476 aa  568  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
477 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 
484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 
466 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
468 aa  511  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 
465 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
466 aa  508  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
468 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
466 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
466 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 
466 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
466 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
466 aa  500  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
466 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
465 aa  495  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
465 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
465 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
465 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
465 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
465 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
465 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
465 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
465 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
465 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
465 aa  481  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
487 aa  478  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
493 aa  476  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
460 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 
485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
479 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
470 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
485 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 
461 aa  465  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
474 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
493 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
470 aa  464  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
485 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
487 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
485 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
481 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
455 aa  457  1e-127  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
493 aa  455  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  48.77 
 
 
485 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
486 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
485 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
485 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
465 aa  451  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
484 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
484 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
483 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
460 aa  450  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
460 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
459 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
472 aa  448  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
461 aa  450  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
476 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
485 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
455 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
458 aa  448  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
447 aa  442  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
464 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
472 aa  444  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
447 aa  444  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
459 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
494 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
501 aa  440  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
456 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
459 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
463 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  48 
 
 
459 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
460 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
459 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
459 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
480 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
465 aa  437  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
448 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
459 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>