More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0334 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0334  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  100 
 
 		 826 aa  1662    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.28 
 
 		 893 aa  494  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.55 
 
 		 900 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.45 
 
 		 893 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.91 
 
 		 893 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.11 
 
 		 898 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  34.24 
 
 		 899 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.6 
 
 		 917 aa  412  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.02 
 
 		 900 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  34.82 
 
 		 828 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.49 
 
 		 901 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.88 
 
 		 905 aa  360  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.06 
 
 		 904 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.61 
 
 		 886 aa  355  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  31.13 
 
 		 826 aa  353  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  32.74 
 
 		 828 aa  350  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  33.07 
 
 		 879 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.69 
 
 		 920 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.79 
 
 		 879 aa  337  3.9999999999999995e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.55 
 
 		 959 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.43 
 
 		 959 aa  337  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  30.97 
 
 		 822 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.84 
 
 		 906 aa  336  1e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  31.02 
 
 		 844 aa  335  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.09 
 
 		 947 aa  333  5e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.33 
 
 		 960 aa  333  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.99 
 
 		 911 aa  332  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.14 
 
 		 948 aa  332  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.05 
 
 		 948 aa  332  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.45 
 
 		 959 aa  331  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.61 
 
 		 959 aa  330  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.24 
 
 		 960 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.77 
 
 		 967 aa  329  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.32 
 
 		 973 aa  329  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  30.25 
 
 		 831 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 960 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.23 
 
 		 946 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.13 
 
 		 948 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.02 
 
 		 948 aa  327  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.35 
 
 		 944 aa  326  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.22 
 
 		 946 aa  326  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.75 
 
 		 979 aa  326  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.97 
 
 		 959 aa  325  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  29.38 
 
 		 843 aa  325  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  31.16 
 
 		 977 aa  325  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  31.21 
 
 		 815 aa  323  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1473  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.31 
 
 		 947 aa  323  7e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0442327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 		 959 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.76 
 
 		 951 aa  322  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.23 
 
 		 984 aa  322  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  31.23 
 
 		 984 aa  321  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.83 
 
 		 983 aa  321  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.18 
 
 		 984 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.54 
 
 		 969 aa  321  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.19 
 
 		 948 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.68 
 
 		 984 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.68 
 
 		 984 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.68 
 
 		 984 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.68 
 
 		 984 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.1 
 
 		 984 aa  320  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.72 
 
 		 966 aa  320  7e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  30.99 
 
 		 982 aa  320  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.01 
 
 		 979 aa  319  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.71 
 
 		 983 aa  319  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.91 
 
 		 983 aa  319  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.87 
 
 		 959 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.5 
 
 		 952 aa  319  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.25 
 
 		 949 aa  318  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  30.36 
 
 		 822 aa  318  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.89 
 
 		 982 aa  318  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.13 
 
 		 903 aa  317  5e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.4 
 
 		 952 aa  317  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  46.26 
 
 		 363 aa  317  7e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.65 
 
 		 983 aa  317  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  33.28 
 
 		 808 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.24 
 
 		 983 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  34.93 
 
 		 821 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.24 
 
 		 983 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  44.06 
 
 		 358 aa  314  4.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.44 
 
 		 950 aa  313  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.97 
 
 		 983 aa  313  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.52 
 
 		 950 aa  312  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.44 
 
 		 950 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  35.08 
 
 		 821 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.73 
 
 		 956 aa  310  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.83 
 
 		 957 aa  310  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.89 
 
 		 1000 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.55 
 
 		 973 aa  308  4.0000000000000004e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  28.76 
 
 		 957 aa  307  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.43 
 
 		 959 aa  306  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.39 
 
 		 351 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.71 
 
 		 994 aa  304  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.79 
 
 		 925 aa  302  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.99 
 
 		 978 aa  302  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2684  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.73 
 
 		 951 aa  301  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.801873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.73 
 
 		 953 aa  300  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.58 
 
 		 960 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  30.58 
 
 		 960 aa  299  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0110  molybdopterin oxidoreductase  32.05 
 
 		 998 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.58 
 
 		 960 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.771386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>