More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0310 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
346 aa  683    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.01 
 
 
346 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.06 
 
 
347 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.81 
 
 
348 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.31 
 
 
349 aa  401  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.51 
 
 
348 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.46 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3011  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.08 
 
 
350 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000165502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.52 
 
 
348 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.82 
 
 
350 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.94 
 
 
350 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.89 
 
 
350 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.63 
 
 
348 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.42 
 
 
348 aa  381  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.42 
 
 
346 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.03 
 
 
336 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.37 
 
 
340 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.82 
 
 
346 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.76 
 
 
347 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.76 
 
 
347 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.84 
 
 
345 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.76 
 
 
347 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.62 
 
 
348 aa  371  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.8 
 
 
346 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.5 
 
 
345 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.5 
 
 
345 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.53 
 
 
346 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.64 
 
 
346 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.21 
 
 
345 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.5 
 
 
346 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.2 
 
 
359 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.52 
 
 
345 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.01 
 
 
346 aa  363  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.59 
 
 
379 aa  363  3e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1137  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.35 
 
 
346 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.42 
 
 
345 aa  362  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.08 
 
 
369 aa  361  9e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.92 
 
 
340 aa  361  1e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.85 
 
 
350 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.01 
 
 
345 aa  359  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.85 
 
 
340 aa  358  9e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.4 
 
 
344 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.96 
 
 
350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.87 
 
 
353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.57 
 
 
345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.57 
 
 
345 aa  355  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.57 
 
 
345 aa  355  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.57 
 
 
345 aa  355  5e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.57 
 
 
345 aa  355  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.57 
 
 
345 aa  355  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  52.57 
 
 
345 aa  355  5e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.57 
 
 
345 aa  355  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.88 
 
 
345 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.96 
 
 
350 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.9 
 
 
345 aa  354  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.52 
 
 
345 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.81 
 
 
348 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.88 
 
 
346 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50 
 
 
346 aa  353  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.27 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.2 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.44 
 
 
346 aa  352  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.28 
 
 
345 aa  352  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0275  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.13 
 
 
347 aa  352  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.12 
 
 
350 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.12 
 
 
350 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.12 
 
 
345 aa  351  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.12 
 
 
345 aa  351  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.12 
 
 
345 aa  351  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.5 
 
 
350 aa  352  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.68 
 
 
339 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.89 
 
 
349 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.37 
 
 
352 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.36 
 
 
346 aa  349  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.3 
 
 
363 aa  350  3e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.62 
 
 
351 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.62 
 
 
351 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.62 
 
 
351 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.34 
 
 
333 aa  349  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.62 
 
 
351 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.62 
 
 
351 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.64 
 
 
356 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.47 
 
 
358 aa  348  9e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.15 
 
 
331 aa  347  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.866173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.6 
 
 
353 aa  347  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.32 
 
 
351 aa  347  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.29 
 
 
350 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.33 
 
 
352 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.32 
 
 
351 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50 
 
 
349 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0456  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.81 
 
 
360 aa  347  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1720  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.55 
 
 
368 aa  347  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.98 
 
 
345 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.19 
 
 
345 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.652409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.27 
 
 
345 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.02 
 
 
351 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1650  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.62 
 
 
368 aa  346  4e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.81226  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2421  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.56 
 
 
349 aa  346  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.7 
 
 
349 aa  345  5e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.56 
 
 
349 aa  345  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.429765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>