More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0304 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  100 
 
 
347 aa  682    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  60.44 
 
 
328 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  63.95 
 
 
328 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  59.46 
 
 
347 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  55.26 
 
 
343 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  60.2 
 
 
309 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  55.26 
 
 
343 aa  359  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  53.87 
 
 
348 aa  359  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  53.33 
 
 
351 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  60.9 
 
 
317 aa  349  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  53.33 
 
 
355 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  48.09 
 
 
342 aa  346  4e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  55.16 
 
 
316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  49.13 
 
 
344 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  52.36 
 
 
315 aa  332  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  54.29 
 
 
314 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  52.65 
 
 
323 aa  323  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  53 
 
 
316 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  53.47 
 
 
343 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  47.65 
 
 
354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  52.07 
 
 
351 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  49.86 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  48.96 
 
 
344 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  54.67 
 
 
345 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  47.29 
 
 
352 aa  308  6.999999999999999e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  53.57 
 
 
346 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  52.41 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  49.85 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  51.38 
 
 
340 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  48.07 
 
 
343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  48.15 
 
 
350 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  48.37 
 
 
343 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  49.53 
 
 
326 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  47.65 
 
 
348 aa  298  8e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  51.45 
 
 
327 aa  295  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  46.55 
 
 
343 aa  288  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  49.35 
 
 
321 aa  286  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  52.61 
 
 
319 aa  286  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  50.32 
 
 
317 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  48.82 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  46.04 
 
 
356 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  42.2 
 
 
358 aa  282  6.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  52.9 
 
 
291 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  45.75 
 
 
356 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  46.97 
 
 
351 aa  280  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  44.81 
 
 
360 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  45.91 
 
 
321 aa  275  9e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  45.1 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  45.24 
 
 
354 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  45.24 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  44.64 
 
 
354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  46.18 
 
 
314 aa  269  7e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  44.64 
 
 
357 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  44.64 
 
 
357 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  44.35 
 
 
357 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  44.41 
 
 
357 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  43.2 
 
 
359 aa  265  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  44.02 
 
 
354 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  42.9 
 
 
357 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  42.22 
 
 
353 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  44.64 
 
 
389 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  44.25 
 
 
389 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  43.55 
 
 
317 aa  263  3e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  44.18 
 
 
354 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  44.18 
 
 
356 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  44.18 
 
 
354 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  44.48 
 
 
325 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  43.75 
 
 
385 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  43.15 
 
 
358 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  43.75 
 
 
421 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  43.88 
 
 
356 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  42.42 
 
 
346 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  45.35 
 
 
355 aa  259  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  44.65 
 
 
352 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  42.49 
 
 
348 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  42.9 
 
 
347 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  42.3 
 
 
352 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  47.57 
 
 
297 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  43.07 
 
 
369 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  41.71 
 
 
351 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  46.73 
 
 
328 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  41.92 
 
 
354 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  42.3 
 
 
352 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  42.3 
 
 
352 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  43.06 
 
 
352 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  42.3 
 
 
352 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  42.55 
 
 
351 aa  255  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  41.49 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  43.31 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3716  selenophosphate synthetase  43.75 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  43.75 
 
 
351 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  42.86 
 
 
348 aa  252  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  43.44 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  44.51 
 
 
349 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  42.49 
 
 
352 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  44.59 
 
 
352 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3450  selenophosphate synthetase  43.45 
 
 
351 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111292  normal  0.645552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  41.64 
 
 
671 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  41.64 
 
 
359 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  42.12 
 
 
355 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>