More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0290 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  67.45 
 
 
513 aa  713    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  63.11 
 
 
520 aa  699    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  70.1 
 
 
523 aa  756    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  60.8 
 
 
527 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  100 
 
 
549 aa  1135    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  52.24 
 
 
582 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  52.65 
 
 
583 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  50.22 
 
 
581 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  50 
 
 
579 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  51.91 
 
 
578 aa  465  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  52.05 
 
 
573 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  51.39 
 
 
582 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  48.47 
 
 
593 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  52.05 
 
 
573 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  51.62 
 
 
573 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  50.76 
 
 
573 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  51.52 
 
 
573 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  49.04 
 
 
582 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  50.76 
 
 
574 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  48.28 
 
 
696 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  48.28 
 
 
696 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  52.7 
 
 
590 aa  445  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  48.76 
 
 
576 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  49.68 
 
 
580 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  50.98 
 
 
578 aa  435  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  48.47 
 
 
582 aa  426  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  50.22 
 
 
570 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  49.79 
 
 
625 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  50.32 
 
 
615 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  46.07 
 
 
574 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  47.59 
 
 
606 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  45.07 
 
 
598 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  45.82 
 
 
594 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  49.57 
 
 
581 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  47.86 
 
 
569 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  48.15 
 
 
582 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  48.04 
 
 
563 aa  411  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000128912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  49.46 
 
 
585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  47.75 
 
 
582 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  46.98 
 
 
586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  46.64 
 
 
572 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  46.2 
 
 
572 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  47.64 
 
 
585 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  47.84 
 
 
585 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  46.93 
 
 
578 aa  388  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  43.15 
 
 
666 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  47.6 
 
 
587 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  42.8 
 
 
619 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  44.49 
 
 
582 aa  378  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  46.71 
 
 
587 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  47.65 
 
 
458 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  46.3 
 
 
577 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  50.77 
 
 
387 aa  360  5e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  41 
 
 
582 aa  353  4e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  49.36 
 
 
439 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  41.53 
 
 
644 aa  350  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  40.5 
 
 
562 aa  343  5e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  48.68 
 
 
417 aa  342  9e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  40.82 
 
 
601 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  40.21 
 
 
566 aa  341  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  39.76 
 
 
1150 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  51.37 
 
 
418 aa  339  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  43.32 
 
 
596 aa  337  2.9999999999999997e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  41.39 
 
 
460 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  47.55 
 
 
421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  37.84 
 
 
567 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  41.03 
 
 
659 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  47.73 
 
 
421 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  43.73 
 
 
410 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  43.98 
 
 
410 aa  319  9e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  40.35 
 
 
644 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  43.98 
 
 
410 aa  318  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  40.84 
 
 
569 aa  318  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  38.58 
 
 
667 aa  310  5e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  36.54 
 
 
653 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  33.98 
 
 
666 aa  264  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  36.17 
 
 
645 aa  259  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  36.17 
 
 
645 aa  258  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  29.25 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33837  predicted protein  29.91 
 
 
473 aa  163  9e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.40604 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03632  iron-sulfur cluster assembly associated protein Nar1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11960)  28.38 
 
 
590 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.436133 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2579  [Fe] hydrogenase  26.81 
 
 
490 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2900  [Fe] hydrogenase  27.54 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  27.03 
 
 
531 aa  113  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  28.16 
 
 
484 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33268  nuclear architecture related protein  29.31 
 
 
545 aa  107  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02870  Ferredoxin hydrogenase  24.86 
 
 
456 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.417058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  28.15 
 
 
491 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  25.49 
 
 
482 aa  101  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  26.88 
 
 
507 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  26.67 
 
 
569 aa  96.7  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  26.73 
 
 
485 aa  97.1  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  28.09 
 
 
490 aa  94  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  28.07 
 
 
454 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  27.01 
 
 
482 aa  90.5  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  25.21 
 
 
483 aa  90.5  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  27.37 
 
 
493 aa  90.1  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  27.22 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  24.07 
 
 
478 aa  89.4  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03410  iron hydrogenase, putative  35.06 
 
 
650 aa  85.1  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>