More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0226 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  70.37 
 
 
509 aa  727    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  64.39 
 
 
507 aa  657    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  69.68 
 
 
517 aa  714    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
525 aa  1064    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  67.67 
 
 
532 aa  698    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  63.98 
 
 
509 aa  656    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  70.26 
 
 
505 aa  745    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  61.85 
 
 
503 aa  631  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  58.79 
 
 
508 aa  611  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  60.58 
 
 
536 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  59.44 
 
 
515 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  57.4 
 
 
505 aa  598  1e-170  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  57.2 
 
 
505 aa  594  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  57.68 
 
 
505 aa  594  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  59.14 
 
 
536 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  58.69 
 
 
531 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  59.14 
 
 
536 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  57.72 
 
 
514 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  59.3 
 
 
541 aa  584  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  58.08 
 
 
509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  59.11 
 
 
541 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  57.09 
 
 
513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  57.75 
 
 
530 aa  577  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  56.92 
 
 
546 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  55.58 
 
 
507 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  54.51 
 
 
510 aa  567  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  55.16 
 
 
503 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  55.89 
 
 
510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  54.16 
 
 
539 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  56.55 
 
 
540 aa  562  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  56.26 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  54.34 
 
 
539 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  56.26 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  57.68 
 
 
513 aa  561  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  53.75 
 
 
522 aa  559  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  57.34 
 
 
516 aa  559  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  55.1 
 
 
512 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  56.39 
 
 
513 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  56.77 
 
 
511 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  55.33 
 
 
515 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  57.25 
 
 
536 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  53.51 
 
 
499 aa  555  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  56.77 
 
 
512 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  53.1 
 
 
522 aa  551  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  55.13 
 
 
515 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  55.81 
 
 
546 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  56.77 
 
 
514 aa  549  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  56.8 
 
 
516 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  56.06 
 
 
515 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  57.71 
 
 
511 aa  548  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  55.4 
 
 
516 aa  548  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  56.22 
 
 
513 aa  549  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  56.77 
 
 
511 aa  549  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  55.33 
 
 
519 aa  548  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 
546 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  57.65 
 
 
510 aa  548  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  55.31 
 
 
516 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  55.78 
 
 
513 aa  547  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  54.06 
 
 
524 aa  547  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 
511 aa  545  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  55.86 
 
 
546 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  53.66 
 
 
523 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  56.37 
 
 
516 aa  548  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  56.51 
 
 
515 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  56.36 
 
 
540 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  55.56 
 
 
520 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  54.87 
 
 
508 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  52.18 
 
 
523 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  56.23 
 
 
517 aa  540  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  55.51 
 
 
515 aa  541  9.999999999999999e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  53.77 
 
 
521 aa  538  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  54.93 
 
 
518 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  53.28 
 
 
515 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  54.02 
 
 
504 aa  533  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  55.47 
 
 
514 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  53.8 
 
 
568 aa  533  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  56.49 
 
 
515 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  55.6 
 
 
515 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 
555 aa  534  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  56.26 
 
 
516 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  55.58 
 
 
511 aa  530  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  54.01 
 
 
519 aa  531  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 
518 aa  531  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  54.11 
 
 
524 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  53.86 
 
 
514 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 
504 aa  525  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  52.62 
 
 
506 aa  527  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09181  2-isopropylmalate synthase  54.46 
 
 
540 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  53.86 
 
 
514 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  53 
 
 
506 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  52.8 
 
 
506 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  53 
 
 
506 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  52.8 
 
 
506 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0727  2-isopropylmalate synthase  55.98 
 
 
540 aa  522  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  52.8 
 
 
506 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  52.11 
 
 
528 aa  525  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  53.61 
 
 
527 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  53.86 
 
 
514 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  53.86 
 
 
514 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  55.03 
 
 
516 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>