135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0218 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  888    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  52.88 
 
 
470 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  49.79 
 
 
467 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  47.42 
 
 
467 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  52.97 
 
 
459 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  43.97 
 
 
468 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  43.17 
 
 
463 aa  349  7e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  39.61 
 
 
466 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  38.86 
 
 
462 aa  333  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  39.48 
 
 
474 aa  318  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  39.32 
 
 
468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  37.55 
 
 
481 aa  303  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  41.12 
 
 
420 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  38.75 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  37.31 
 
 
458 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  59.04 
 
 
174 aa  199  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01530  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  39.36 
 
 
275 aa  199  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02480  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  39.36 
 
 
275 aa  199  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  59.04 
 
 
174 aa  199  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  35.34 
 
 
438 aa  192  8e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  35.43 
 
 
438 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  35.33 
 
 
438 aa  183  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  56.55 
 
 
174 aa  179  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  58.24 
 
 
174 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  58.24 
 
 
174 aa  178  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  53.09 
 
 
173 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  53.33 
 
 
172 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  47.98 
 
 
180 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  52.41 
 
 
172 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0237  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  34.48 
 
 
268 aa  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2866  AMMECR1 domain-containing protein  39.26 
 
 
189 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  42.86 
 
 
200 aa  97.8  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  35.42 
 
 
197 aa  96.7  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  36.99 
 
 
188 aa  96.3  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  38.51 
 
 
194 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  37.78 
 
 
181 aa  93.2  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  38.24 
 
 
202 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  33.9 
 
 
190 aa  87.8  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  35.36 
 
 
200 aa  87.4  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  44.14 
 
 
191 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  34.34 
 
 
179 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  36.57 
 
 
205 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  38.3 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  38.3 
 
 
203 aa  84  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  32.34 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  38.41 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  34.9 
 
 
180 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  34.5 
 
 
185 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0840  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  27.56 
 
 
279 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  40.15 
 
 
254 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  26.1 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  42.02 
 
 
186 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  39.13 
 
 
199 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  32.33 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  40.28 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0748  AMMECR1 domain-containing protein  40.54 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  36.76 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  33.93 
 
 
522 aa  77  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  29.95 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  29.95 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  35.34 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  35.21 
 
 
484 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  25.17 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  30.73 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  39.1 
 
 
196 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1407  hypothetical protein  26.3 
 
 
259 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  30.03 
 
 
464 aa  71.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  24.91 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  33.82 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  36.71 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1497  AMMECR1 domain protein  34.09 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  32.37 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  34.34 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  31.25 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2470  AMMECR1 domain protein  32.26 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  35.71 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  34.09 
 
 
184 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  31.78 
 
 
183 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02500  hypothetical protein  28.24 
 
 
141 aa  67.4  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.360289  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  38.64 
 
 
184 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  37.88 
 
 
184 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  32.03 
 
 
187 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  34.19 
 
 
188 aa  64.7  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  29.89 
 
 
191 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  37.88 
 
 
184 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2767  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 
257 aa  63.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0410  AMMECR1 domain protein  31.21 
 
 
204 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  35.75 
 
 
221 aa  62.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0449  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  29.18 
 
 
252 aa  63.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  34.87 
 
 
219 aa  62.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  32.7 
 
 
187 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3868  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  26.64 
 
 
283 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  35 
 
 
187 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  32.1 
 
 
224 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  37.68 
 
 
202 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2031  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase(HpaD)  27.05 
 
 
287 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412165  normal  0.21533 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  32.17 
 
 
213 aa  60.5  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  35.61 
 
 
191 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  39.37 
 
 
233 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>