More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0136 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
149 aa  290  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  54.73 
 
 
301 aa  150  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  46.94 
 
 
154 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  43.15 
 
 
153 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  51.22 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  46 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  49.6 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  49.6 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  43.17 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  51 
 
 
142 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  49.59 
 
 
157 aa  107  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  36.84 
 
 
156 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  40.65 
 
 
159 aa  105  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  35.4 
 
 
162 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  42.59 
 
 
142 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  40.91 
 
 
156 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  37.82 
 
 
156 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  35.76 
 
 
158 aa  103  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  52.53 
 
 
195 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  54.29 
 
 
159 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  48.18 
 
 
190 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  40.69 
 
 
147 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  47.22 
 
 
168 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  52.69 
 
 
152 aa  100  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  35.71 
 
 
156 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  36.36 
 
 
156 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  44.09 
 
 
190 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  35.71 
 
 
156 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  35.06 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  42.76 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  53.4 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  36.03 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  47.54 
 
 
157 aa  97.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  45.67 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  35.53 
 
 
161 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  45.19 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  47.12 
 
 
176 aa  97.1  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  41.82 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  50.54 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  49.17 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  49.59 
 
 
161 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  47.22 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  45.52 
 
 
167 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  52.17 
 
 
159 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  34.07 
 
 
155 aa  94  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  46.22 
 
 
153 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  52.17 
 
 
159 aa  93.6  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  48.08 
 
 
205 aa  93.6  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  48.94 
 
 
158 aa  93.6  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  33.77 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  44.55 
 
 
171 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  37.69 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  49.59 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  43.7 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  42.52 
 
 
158 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  33.77 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  33.77 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  33.77 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  45.24 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  46.3 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  33.77 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  46.3 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  33.77 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  33.77 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  41.72 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  43.75 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  46.3 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  46.3 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  51.65 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  52.17 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  51.65 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  34.06 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  34.06 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  49.06 
 
 
176 aa  91.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  53.26 
 
 
161 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  45.71 
 
 
168 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  44.26 
 
 
161 aa  90.9  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  37.17 
 
 
154 aa  90.9  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  46.53 
 
 
193 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  51.65 
 
 
155 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  51.65 
 
 
155 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  36.36 
 
 
180 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  51.65 
 
 
155 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  51.65 
 
 
155 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  51.65 
 
 
155 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  51.65 
 
 
155 aa  90.1  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  51.65 
 
 
155 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  47.62 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  45.87 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  48.76 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  37.25 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  40.41 
 
 
185 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  40.58 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  44.64 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  43.75 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  42.06 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  45.67 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  44.64 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  46.3 
 
 
157 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  38.27 
 
 
157 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>