More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0126 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.53 
 
 
779 aa  654    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  50 
 
 
683 aa  653    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
685 aa  1373    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.38 
 
 
692 aa  687    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.54 
 
 
685 aa  729    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.02 
 
 
680 aa  613  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.57 
 
 
689 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.35 
 
 
694 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.27 
 
 
786 aa  594  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.36 
 
 
767 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.79 
 
 
714 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.97 
 
 
681 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.65 
 
 
829 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.43 
 
 
776 aa  576  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  44.98 
 
 
818 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.89 
 
 
772 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.12 
 
 
740 aa  569  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.06 
 
 
772 aa  567  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.48 
 
 
682 aa  568  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.45 
 
 
781 aa  562  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.72 
 
 
682 aa  558  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.91 
 
 
763 aa  561  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.46 
 
 
805 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.76 
 
 
779 aa  561  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.2 
 
 
818 aa  561  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.69 
 
 
778 aa  558  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.41 
 
 
682 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.41 
 
 
682 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.41 
 
 
682 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.41 
 
 
682 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.41 
 
 
682 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.48 
 
 
700 aa  558  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.37 
 
 
682 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.7 
 
 
765 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.26 
 
 
682 aa  555  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.77 
 
 
682 aa  552  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.14 
 
 
685 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.6 
 
 
679 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.87 
 
 
842 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.74 
 
 
682 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.14 
 
 
657 aa  544  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.78 
 
 
773 aa  544  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.86 
 
 
688 aa  544  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.31 
 
 
817 aa  544  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.71 
 
 
787 aa  544  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.59 
 
 
681 aa  543  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.12 
 
 
832 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.1 
 
 
842 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.74 
 
 
903 aa  537  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.65 
 
 
712 aa  537  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.88 
 
 
678 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.63 
 
 
776 aa  532  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.8 
 
 
706 aa  531  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.79 
 
 
862 aa  525  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.01 
 
 
717 aa  527  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.82 
 
 
706 aa  527  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.13 
 
 
703 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.34 
 
 
827 aa  527  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.87 
 
 
818 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.91 
 
 
819 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.91 
 
 
819 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.51 
 
 
678 aa  519  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.31 
 
 
676 aa  519  1e-146  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.56 
 
 
676 aa  520  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.33 
 
 
672 aa  521  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.09 
 
 
671 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1371  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.48 
 
 
710 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.393956  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.28 
 
 
678 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.26 
 
 
691 aa  512  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.68 
 
 
679 aa  513  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.27 
 
 
707 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.34 
 
 
706 aa  514  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.73 
 
 
696 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.56 
 
 
703 aa  510  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.93 
 
 
693 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.87 
 
 
696 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.88 
 
 
690 aa  510  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.73 
 
 
691 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.27 
 
 
772 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.73 
 
 
691 aa  506  9.999999999999999e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.73 
 
 
696 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.85 
 
 
697 aa  507  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.56 
 
 
695 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.51 
 
 
691 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.29 
 
 
696 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.29 
 
 
696 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.71 
 
 
693 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.73 
 
 
696 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.6 
 
 
904 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.36 
 
 
753 aa  502  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.98 
 
 
691 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.24 
 
 
689 aa  505  1e-141  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.29 
 
 
691 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.45 
 
 
693 aa  499  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.93 
 
 
688 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.7 
 
 
693 aa  502  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.05 
 
 
815 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.12 
 
 
693 aa  501  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 
702 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.84 
 
 
696 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>