More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0098 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 432 aa  852    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  35.73 
 
 		 379 aa  203  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.68 
 
 		 397 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.65 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  32.1 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  32.24 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.84 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  29.4 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.55 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.91 
 
 		 448 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  26.25 
 
 		 287 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  26.81 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.94 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  28.65 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.81 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.9 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.9 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 		 419 aa  110  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.33 
 
 		 380 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.82 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.3 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  25.53 
 
 		 399 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  27.27 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.82 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.2 
 
 		 438 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 		 376 aa  103  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0988  secretion protein HlyD  27.64 
 
 		 415 aa  103  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  26.51 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  28.91 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  27.7 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.52 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  31.11 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  30.4 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  31.44 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.13 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  29.1 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3158  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.08 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.85 
 
 		 490 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  23.59 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.06 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2960  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.83 
 
 		 463 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.401825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  30.3 
 
 		 489 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  26.53 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  31.6 
 
 		 397 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  26.58 
 
 		 376 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  27.27 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  25.55 
 
 		 500 aa  96.3  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.47 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.06 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2454  RND family efflux transporter MFP subunit  31.73 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 448 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  24.87 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.47 
 
 		 329 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  26.12 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  30.65 
 
 		 368 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.79 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4789  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 392 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.6 
 
 		 496 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  28.24 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  28.1 
 
 		 398 aa  94.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 496 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 		 372 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  28.22 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.97 
 
 		 475 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  25.43 
 
 		 423 aa  94  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 374 aa  94  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.74 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  24.89 
 
 		 374 aa  93.6  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  29.1 
 
 		 334 aa  93.6  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  27.59 
 
 		 416 aa  93.6  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 		 405 aa  93.2  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  28 
 
 		 401 aa  93.2  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.39 
 
 		 467 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  25.47 
 
 		 350 aa  92.8  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  28 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  24.42 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  29.62 
 
 		 330 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1672  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.35 
 
 		 359 aa  92.8  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  33.18 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.03 
 
 		 580 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.5 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.29 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.93 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  30.94 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  26.62 
 
 		 471 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>