76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0093 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  100 
 
 
112 aa  219  1e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  40.59 
 
 
122 aa  82  3e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1892  hypothetical protein  45.22 
 
 
116 aa  80.9  6e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.156341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  32.74 
 
 
118 aa  75.5  3e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  33.04 
 
 
113 aa  74.7  4e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  43.3 
 
 
112 aa  67.8  5e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  1.75504e-06 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  37.89 
 
 
115 aa  67  8e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  38.61 
 
 
117 aa  63.5  8e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.7585e-10  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  32.74 
 
 
114 aa  59.7  1e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  32.74 
 
 
114 aa  59.7  1e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  30.39 
 
 
118 aa  53.1  1e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  29.66 
 
 
139 aa  47.8  6e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  34.67 
 
 
117 aa  47.4  6e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  30.51 
 
 
122 aa  47.4  7e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  3.23664e-07 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  33.77 
 
 
120 aa  47.4  7e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  28.87 
 
 
114 aa  47.4  7e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  27.97 
 
 
123 aa  47  8e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  29.66 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  26.5 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3399  multidrug resistance protein, SMR family  47.17 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  29.66 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2403  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2553  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.676636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  40.28 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  28.33 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02184  hypothetical protein  47.17 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1391  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02143  hypothetical protein  47.17 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2634  multidrug resistance protein, SMR family  47.17 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0607087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2412  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1400  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  40.3 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  37.84 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  27.19 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  27.19 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  38.03 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  28.07 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  38.03 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  38.03 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  28.07 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  33.02 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  27.19 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  2.74513e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  41.07 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2477  hypothetical protein  32.95 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.73753e-05 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  39.66 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  26.02 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  38.81 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4230  hypothetical protein  39.68 
 
 
132 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  35.21 
 
 
147 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0286  hypothetical protein  28.43 
 
 
121 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.248934  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  29.37 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  29.51 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.01456e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  25.44 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  25.44 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  1.99647e-06 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  25.44 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  38.46 
 
 
300 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  26.23 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  31.73 
 
 
122 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  28.1 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.16346e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  40 
 
 
304 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  38.46 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  35.14 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  38.57 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3229  hypothetical protein  30.19 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  38.57 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  31.17 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  38.57 
 
 
159 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  30.23 
 
 
126 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>