More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0083 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
474 aa  638  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4100  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
460 aa  649  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.740687  normal  0.359635 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1273  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.83 
 
 
468 aa  676  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4262  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
460 aa  649  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.227124  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4226  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 
460 aa  652  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  89.38 
 
 
472 aa  845  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5431  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.69 
 
 
458 aa  657  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.58 
 
 
469 aa  671  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4202  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 
460 aa  652  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16362  normal  0.223697 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2148  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.15 
 
 
461 aa  653  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 
464 aa  659  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
467 aa  667  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0420  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 
469 aa  647  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.62 
 
 
472 aa  674  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.75 
 
 
463 aa  659  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5200  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.47 
 
 
458 aa  657  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.378441  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 
458 aa  658  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0122  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.83 
 
 
464 aa  655  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
484 aa  637  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.25 
 
 
475 aa  689  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03113  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.65 
 
 
468 aa  650  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3512  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.83 
 
 
469 aa  657  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000535671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3894  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 
464 aa  659  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4189  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
460 aa  649  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212641  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0506  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 
473 aa  640  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.452811 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3027  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.47 
 
 
464 aa  662  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0424  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.96 
 
 
466 aa  646  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
464 aa  657  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0022  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
466 aa  656  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0274087  hitchhiker  0.000479158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3526  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.86 
 
 
474 aa  647  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0485  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.17 
 
 
466 aa  647  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.15 
 
 
484 aa  642  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 
474 aa  644  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.55 
 
 
467 aa  677  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.47 
 
 
458 aa  659  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  2.25829e-08 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.67 
 
 
509 aa  640  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
470 aa  634  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.57 
 
 
469 aa  670  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.5 
 
 
475 aa  653  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5295  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.69 
 
 
458 aa  656  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.122474 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
470 aa  634  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1181  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.83 
 
 
468 aa  676  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.186447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.01 
 
 
480 aa  644  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.05 
 
 
476 aa  643  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.36 
 
 
470 aa  721  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2528  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 
467 aa  654  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.47 
 
 
458 aa  653  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.54 
 
 
463 aa  657  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.91 
 
 
458 aa  650  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.75 
 
 
463 aa  659  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.07 
 
 
464 aa  682  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4240  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.32 
 
 
458 aa  655  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.695259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.83 
 
 
460 aa  648  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4486  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.68 
 
 
458 aa  651  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.21569e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
460 aa  649  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 
460 aa  649  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06104  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.88 
 
 
461 aa  649  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00421  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.37 
 
 
467 aa  651  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.15 
 
 
483 aa  652  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
478 aa  645  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.63 
 
 
472 aa  692  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 
465 aa  639  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 
460 aa  652  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 
484 aa  636  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.75 
 
 
481 aa  694  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.69 
 
 
460 aa  654  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.12 
 
 
462 aa  675  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  67.51 
 
 
482 aa  658  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.15 
 
 
470 aa  715  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.7844e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4257  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 
460 aa  649  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4194  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.83 
 
 
460 aa  651  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.821346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03560  hypothetical protein  70.04 
 
 
460 aa  649  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3993  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.61 
 
 
460 aa  649  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3187  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.83 
 
 
469 aa  657  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.575632  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.1 
 
 
473 aa  684  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4869  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.34 
 
 
466 aa  638  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52160  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 
458 aa  649  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.32 
 
 
484 aa  646  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.28 
 
 
467 aa  696  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.82 
 
 
459 aa  671  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  72.44 
 
 
487 aa  697  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.4 
 
 
465 aa  655  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 
483 aa  636  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3366  ATP synthase F1, beta subunit  72.13 
 
 
469 aa  667  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  70.66 
 
 
467 aa  674  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2587  ATP synthase F1, beta subunit  69.4 
 
 
458 aa  655  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282932  normal  0.0250722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  66.31 
 
 
470 aa  645  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_503  ATP synthase F1, beta subunit  66.31 
 
 
464 aa  634  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0039983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  73.02 
 
 
471 aa  699  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  71.79 
 
 
465 aa  683  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  70.24 
 
 
464 aa  668  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002030  ATP synthase beta chain  68.15 
 
 
467 aa  655  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6062  ATP synthase F1, beta subunit  66.67 
 
 
481 aa  648  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  67.97 
 
 
462 aa  637  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4547  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 
460 aa  650  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.53 
 
 
473 aa  686  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
475 aa  954  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  71.4 
 
 
468 aa  693  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.8 
 
 
474 aa  749  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.78 
 
 
484 aa  645  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>