More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0077 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  56 
 
 
257 aa  276  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  45.71 
 
 
246 aa  220  2e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  45.75 
 
 
262 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  39.22 
 
 
245 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.01966e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  39.15 
 
 
229 aa  126  4e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.05788e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  35.78 
 
 
229 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.61102e-06  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 
242 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 
242 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  34.4 
 
 
229 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  33.78 
 
 
229 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.43086e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
229 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.86 
 
 
230 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  2.47619e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  36.36 
 
 
234 aa  117  2e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  34.86 
 
 
229 aa  114  1e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  34.86 
 
 
229 aa  114  2e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.62325e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  37.83 
 
 
251 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  3.81865e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  37.83 
 
 
251 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  35.19 
 
 
239 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.37067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  34.38 
 
 
237 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  38.17 
 
 
229 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  38.92 
 
 
271 aa  110  2e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  36.11 
 
 
257 aa  108  8e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  35.62 
 
 
218 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  30.9 
 
 
242 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  35.22 
 
 
252 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  34.57 
 
 
249 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  38.17 
 
 
234 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.26077e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  33.04 
 
 
234 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  33.02 
 
 
239 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  30.7 
 
 
224 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  32.34 
 
 
239 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  31.9 
 
 
239 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  31.9 
 
 
239 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.03666e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  32.34 
 
 
239 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.58416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  32.34 
 
 
239 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  32.34 
 
 
239 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.42727e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  32.34 
 
 
239 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  32.34 
 
 
239 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  31.9 
 
 
239 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.10336e-05  hitchhiker  3.28708e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  32.44 
 
 
236 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  9.02841e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2331  ATP synthase F0, A subunit  31.39 
 
 
273 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.17448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3209  ATP synthase F0, A subunit  30.38 
 
 
249 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2813  ATP synthase F0, A subunit  30.38 
 
 
249 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0159651  normal  0.290047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  34.33 
 
 
253 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  31.86 
 
 
207 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.17673e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  32.93 
 
 
251 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  35.27 
 
 
217 aa  99  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  31.03 
 
 
239 aa  99  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  32.21 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  36.09 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  32.44 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  29.89 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03107  F0F1 ATP synthase subunit A  34.5 
 
 
251 aa  96.3  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  31.11 
 
 
233 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3517  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  32.68 
 
 
226 aa  95.9  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1279  F0F1 ATP synthase subunit A  33.9 
 
 
280 aa  95.5  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0786025  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  32.69 
 
 
226 aa  95.5  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  32.69 
 
 
226 aa  95.5  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  29.69 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3987  ATP synthase F0, A subunit  32.02 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  33.48 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1175  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.108763  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
241 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4152  F0F1 ATP synthase subunit A  31.06 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00217219  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  29.02 
 
 
301 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.20668e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4202  F0F1 ATP synthase subunit A  31.06 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109875  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1702  F0F1 ATP synthase subunit A  30.23 
 
 
265 aa  94  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.223985  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4081  F0F1 ATP synthase subunit A  31.06 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00982626  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  33.66 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  31.51 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  31.09 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  33.02 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4261  F0F1 ATP synthase subunit A  31.06 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4096  F0F1 ATP synthase subunit A  31.06 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  5.20187e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  32.88 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.49 
 
 
295 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  32.16 
 
 
233 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2916  F0F1 ATP synthase subunit A  31.64 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3059  F0F1 ATP synthase subunit A  31.64 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4188  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 
263 aa  92  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.18373e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3065  F0F1 ATP synthase subunit A  31.4 
 
 
270 aa  92  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  32.24 
 
 
340 aa  92  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  6.77372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  33.95 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  6.56805e-05  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4251  F0F1 ATP synthase subunit A  29.23 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3080  F0F1 ATP synthase subunit A  31.78 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00958832  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  31.33 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
241 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4126  F0F1 ATP synthase subunit A  30.64 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  4.92327e-07  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
241 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0491  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  3.66273e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4246  F0F1 ATP synthase subunit A  31.46 
 
 
276 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.11234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0430  F0F1 ATP synthase subunit A  32.03 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  2.35432e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2593  ATP synthase F0, A subunit  32.29 
 
 
289 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37726  normal  0.0949349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4541  F0F1 ATP synthase subunit A  28.46 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  3.89155e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  30.47 
 
 
268 aa  89.7  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0002  F0F1 ATP synthase subunit A  28.62 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.55904e-07  hitchhiker  0.00410129 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2522  F0F1 ATP synthase subunit A  30.25 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.45329e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>