More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0071 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
417 aa  846  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  69.59 
 
 
413 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  69.12 
 
 
415 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  68.2 
 
 
413 aa  577  1e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  68.05 
 
 
420 aa  575  1e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  69.23 
 
 
417 aa  573  1e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.0982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  67.97 
 
 
414 aa  568  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 
413 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  66.99 
 
 
415 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 
411 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.28494e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  66.75 
 
 
416 aa  559  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 
417 aa  554  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  65.53 
 
 
412 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  65.46 
 
 
415 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  66.01 
 
 
412 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  65.53 
 
 
418 aa  552  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  62.86 
 
 
412 aa  551  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 
412 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  64.63 
 
 
411 aa  550  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  64.37 
 
 
410 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 
410 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 
417 aa  539  1e-152  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  63.57 
 
 
416 aa  539  1e-152  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 
419 aa  539  1e-152  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.84892e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  64.79 
 
 
415 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 
412 aa  535  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 
415 aa  535  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 
413 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 
417 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  63.39 
 
 
415 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.67671e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  64.48 
 
 
420 aa  532  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 
415 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 
417 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 
415 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 
412 aa  529  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.86 
 
 
415 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 
413 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.15106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 
413 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.29833e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  62.96 
 
 
412 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 
413 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.38182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 
413 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 
414 aa  525  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  62.96 
 
 
412 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 
414 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  61.89 
 
 
413 aa  527  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  61.89 
 
 
413 aa  527  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  3.58223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 
414 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  4.68931e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 
414 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 
414 aa  521  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 
415 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 
413 aa  521  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 
414 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 
413 aa  524  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.94889e-09  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 
414 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 
414 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 
417 aa  520  1e-146  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 
419 aa  519  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 
423 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 
422 aa  514  1e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  61.78 
 
 
431 aa  516  1e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 
423 aa  515  1e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 
427 aa  517  1e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  6.92081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  62.23 
 
 
415 aa  515  1e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 
427 aa  516  1e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 
423 aa  516  1e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  62.23 
 
 
415 aa  515  1e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 
425 aa  517  1e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  62.71 
 
 
415 aa  516  1e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 
425 aa  517  1e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 
415 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  63.86 
 
 
412 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 
415 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 
412 aa  512  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.62006e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 
431 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 
423 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 
412 aa  514  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  61.78 
 
 
429 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  62.23 
 
 
431 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 
415 aa  513  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  60.89 
 
 
435 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1660  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 
414 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445565  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 
415 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 
415 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 
434 aa  508  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2044  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 
414 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 
415 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0413  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
415 aa  506  1e-142  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.774669  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 
427 aa  508  1e-142  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 
415 aa  507  1e-142  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 
417 aa  505  1e-142  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  5.88766e-06  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 
425 aa  507  1e-142  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 
424 aa  507  1e-142  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0436  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
415 aa  507  1e-142  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>