More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0061 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  100 
 
 
66 aa  137  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.49068e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  72.31 
 
 
66 aa  108  2e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.728854 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  65.15 
 
 
66 aa  95.9  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  65.15 
 
 
66 aa  94.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  8.02115e-12  hitchhiker  6.1454e-09 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  66.67 
 
 
69 aa  93.6  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  62.12 
 
 
68 aa  92  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.58788e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  60.61 
 
 
67 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  63.08 
 
 
74 aa  89.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  62.12 
 
 
68 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.15531e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 
66 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 
65 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 
66 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  59.09 
 
 
67 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 
65 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 
66 aa  86.7  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  60.61 
 
 
71 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 
66 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.10329e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.71245e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.89789e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  61.19 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  56.92 
 
 
175 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  56.06 
 
 
70 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 
73 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.69936e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 
75 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  59.7 
 
 
75 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 
70 aa  84  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  58.46 
 
 
153 aa  84  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  3.20944e-09  hitchhiker  2.56974e-13 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  60 
 
 
66 aa  84.3  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 
72 aa  84.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 
65 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.59753e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  60 
 
 
66 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 
66 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.31599e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 
74 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  60.94 
 
 
76 aa  83.2  1e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 
69 aa  82.8  1e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.41122e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  54.55 
 
 
67 aa  82.4  2e-15  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 
81 aa  81.6  3e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 
81 aa  81.6  3e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 
81 aa  81.6  3e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  56.92 
 
 
144 aa  82  3e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  4.89926e-05 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 
82 aa  80.9  5e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  57.35 
 
 
68 aa  80.9  5e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  59.7 
 
 
68 aa  80.5  6e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  3.50095e-10  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  53.33 
 
 
70 aa  80.5  7e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  58.21 
 
 
82 aa  80.5  7e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 
120 aa  80.5  7e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 
121 aa  80.5  7e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 
72 aa  80.5  7e-15  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 
68 aa  80.5  8e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
79 aa  80.5  8e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
79 aa  80.5  8e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 
68 aa  80.5  8e-15  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  56.06 
 
 
68 aa  80.1  9e-15  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  4.39538e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  59.09 
 
 
67 aa  80.1  9e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 
72 aa  80.1  9e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 
68 aa  80.1  9e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 
120 aa  79.7  1e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  52.94 
 
 
67 aa  80.1  1e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 
75 aa  80.1  1e-14  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  4.14614e-05  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  55.38 
 
 
73 aa  79.7  1e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.94944e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 
70 aa  79.7  1e-14  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 
75 aa  80.1  1e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.43362e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  49.23 
 
 
120 aa  79.7  1e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
75 aa  79  2e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
75 aa  79  2e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  2.64126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0818  ribosomal protein L31  52.31 
 
 
76 aa  79  2e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.68077e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  55.22 
 
 
70 aa  78.6  3e-14  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  58.21 
 
 
70 aa  77.8  4e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 
80 aa  77.8  4e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  53.85 
 
 
139 aa  77.8  5e-14  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
70 aa  77.8  5e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 
115 aa  77.8  5e-14  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  1.40602e-06  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  53.73 
 
 
71 aa  77.8  5e-14  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1165  50S ribosomal protein L31  54.41 
 
 
69 aa  77.4  6e-14  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  3.6585e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 
65 aa  77.4  6e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  8.83025e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  56.06 
 
 
67 aa  77.4  6e-14  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  2.24583e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  53.03 
 
 
71 aa  77.4  6e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  6.65259e-09  hitchhiker  4.07647e-07 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 
74 aa  77  7e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  52.24 
 
 
73 aa  77  7e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  55.22 
 
 
71 aa  77  8e-14  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 
75 aa  76.6  1e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 
72 aa  76.3  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  53.73 
 
 
70 aa  76.3  1e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 
75 aa  76.6  1e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  57.58 
 
 
71 aa  75.5  2e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 
74 aa  75.9  2e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 
69 aa  75.5  2e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  53.03 
 
 
69 aa  75.1  3e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.47794e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  47.76 
 
 
68 aa  74.7  4e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  53.73 
 
 
69 aa  74.7  4e-13  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 
66 aa  74.7  4e-13  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  52.24 
 
 
77 aa  74.7  4e-13  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  2.5459e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 
78 aa  74.7  4e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  56.72 
 
 
74 aa  74.7  4e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>