More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0050 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  62.88 
 
 
563 aa  709  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
564 aa  1139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  56.06 
 
 
570 aa  666  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  9.95895e-08  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 
561 aa  634  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.72186e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 
560 aa  628  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 
561 aa  613  1e-174  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.69325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 
564 aa  612  1e-174  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
564 aa  596  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  9.50947e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
559 aa  592  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
562 aa  577  1e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
561 aa  557  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
556 aa  540  1e-152  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.85624e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
557 aa  531  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
554 aa  519  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 
554 aa  515  1e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
559 aa  510  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
556 aa  508  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
556 aa  511  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
556 aa  507  1e-142  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
556 aa  507  1e-142  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
556 aa  508  1e-142  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
556 aa  507  1e-142  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
556 aa  508  1e-142  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
556 aa  506  1e-142  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
556 aa  505  1e-142  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
556 aa  507  1e-142  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
556 aa  506  1e-142  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
550 aa  502  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
559 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
554 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.56279e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
551 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
546 aa  469  1e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
556 aa  471  1e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
553 aa  470  1e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
586 aa  468  1e-130  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
589 aa  466  1e-130  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
587 aa  467  1e-130  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
586 aa  466  1e-130  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
592 aa  465  1e-130  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
589 aa  467  1e-130  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
584 aa  468  1e-130  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
556 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
556 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
551 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
598 aa  459  1e-128  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
586 aa  459  1e-128  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
587 aa  461  1e-128  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
546 aa  461  1e-128  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
611 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
592 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
556 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
553 aa  452  1e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
553 aa  452  1e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
587 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
561 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
588 aa  450  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
568 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
551 aa  446  1e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
579 aa  447  1e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
579 aa  447  1e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
551 aa  446  1e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
556 aa  439  1e-122  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
553 aa  439  1e-122  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
564 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
585 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
583 aa  437  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
569 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
575 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
562 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
551 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
575 aa  431  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
551 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
609 aa  424  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
563 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
561 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
542 aa  422  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
575 aa  421  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 
549 aa  417  1e-115  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
564 aa  416  1e-115  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
570 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
550 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
550 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
605 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
561 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
550 aa  411  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
562 aa  405  1e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
609 aa  406  1e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
598 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
598 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
522 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
609 aa  402  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
597 aa  399  1e-110  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3972  arginyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
550 aa  402  1e-110  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
553 aa  402  1e-110  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
597 aa  401  1e-110  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
597 aa  400  1e-110  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
543 aa  400  1e-110  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3898  arginyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
550 aa  402  1e-110  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0879275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1899  arginyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
550 aa  401  1e-110  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
550 aa  402  1e-110  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>