33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0041 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
117 aa  227  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  49.07 
 
 
191 aa  97.1  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  1.29079e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  40.78 
 
 
115 aa  64.7  4e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  41.35 
 
 
121 aa  63.2  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  34.58 
 
 
117 aa  61.6  3e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  36.19 
 
 
119 aa  59.7  1e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  40.48 
 
 
115 aa  57.4  6e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  39.62 
 
 
135 aa  57.4  6e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  39.08 
 
 
118 aa  55.5  2e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  36.19 
 
 
126 aa  54.3  6e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  36.9 
 
 
109 aa  52.8  1e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 
117 aa  53.5  1e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  40.43 
 
 
122 aa  52.4  2e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  32.41 
 
 
111 aa  52  3e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  32.38 
 
 
116 aa  47.8  5e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  35.92 
 
 
105 aa  47.4  6e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.75523e-11 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  41.79 
 
 
103 aa  47.4  6e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 
111 aa  47.4  7e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  41.25 
 
 
92 aa  47  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  5.99045e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  35.63 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  37.78 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  1.54582e-07  unclonable  6.93944e-06 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  31.31 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  29.52 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  26.53 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  29.73 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  32.89 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  24.04 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  34.41 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  30.91 
 
 
111 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.29156e-08  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  34.88 
 
 
209 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  32.38 
 
 
106 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  40.74 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>