110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0038 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0038  Deoxyribonuclease V  100 
 
 
226 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2187  deoxyribonuclease V  55.8 
 
 
226 aa  236  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0819  endonuclease V  52.05 
 
 
221 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  8.67821e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0299  endonuclease V  50.7 
 
 
229 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0299  endonuclease V  50.7 
 
 
229 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0602  endonuclease V (deoxyinosine 3'endoduclease)  49.77 
 
 
232 aa  211  6e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.42515e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4912  endonuclease V  49.76 
 
 
227 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.710314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3179  endonuclease V  52.49 
 
 
240 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6148  Deoxyribonuclease V  45.83 
 
 
230 aa  207  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184211  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33580  Endonuclease V  52.05 
 
 
234 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  0.688639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3689  endonuclease V  47.91 
 
 
228 aa  204  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46839  normal  0.0492677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1932  deoxyribonuclease V  47.77 
 
 
234 aa  204  8e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0217  deoxyribonuclease V  51.63 
 
 
219 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.438952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1279  deoxyribonuclease V  51.34 
 
 
223 aa  200  2e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0152491  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3591  deoxyribonuclease V  48.86 
 
 
219 aa  198  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.515588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0569  endonuclease V  48.2 
 
 
221 aa  198  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.50735e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0771  endonuclease V  45.93 
 
 
228 aa  197  1e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.784275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3046  Deoxyribonuclease V  50 
 
 
223 aa  194  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000285667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2924  deoxyribonuclease V  45.66 
 
 
232 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6470  Deoxyribonuclease V  46.86 
 
 
230 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0671268  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1562  deoxyribonuclease V  41.78 
 
 
226 aa  193  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13030  endonuclease V  50.93 
 
 
221 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0543  endonuclease V  48.65 
 
 
223 aa  191  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.65335e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_508  nfi endonuclease V  46.4 
 
 
223 aa  191  8e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  2.19342e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0954  deoxyribonuclease V  45.33 
 
 
225 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000171059  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2526  endonuclease V  48.6 
 
 
227 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.60991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0625  Deoxyribonuclease V  48.86 
 
 
218 aa  189  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2395  deoxyribonuclease V  49.52 
 
 
221 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4060  Deoxyribonuclease V  47.34 
 
 
232 aa  189  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.145804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3356  Deoxyribonuclease V  50.22 
 
 
228 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0932  deoxyribonuclease V  45.41 
 
 
225 aa  189  3e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.51025e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2695  Deoxyribonuclease V  49.04 
 
 
220 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2472  deoxyribonuclease V  49.04 
 
 
220 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2816  Endonuclease V  50.71 
 
 
221 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0284  Deoxyribonuclease V  48.67 
 
 
258 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506028  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0045  endonuclease V  49.76 
 
 
222 aa  185  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1173  deoxyribonuclease V  39.91 
 
 
221 aa  185  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1668  deoxyribonuclease V  50 
 
 
279 aa  184  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal  0.261069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3899  Deoxyribonuclease V  50.46 
 
 
223 aa  184  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172074  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2400  Deoxyribonuclease V  48.56 
 
 
220 aa  184  1e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0714775  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2231  Deoxyribonuclease V  47.42 
 
 
223 aa  183  2e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0289774  hitchhiker  2.93854e-06 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1400  endonuclease V  51.17 
 
 
231 aa  182  5e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2758  deoxyribonuclease V  46.12 
 
 
222 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2382  deoxyribonuclease V  46.12 
 
 
222 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2425  endonuclease V  49.56 
 
 
229 aa  179  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4157  deoxyribonuclease V  50.55 
 
 
189 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0737618  decreased coverage  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3345  deoxyribonuclease V  45.33 
 
 
242 aa  179  3e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  4.97399e-06  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0246  Deoxyribonuclease V  47.93 
 
 
220 aa  179  3e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.520455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0258  deoxyribonuclease V  44.86 
 
 
230 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109742  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3087  Deoxyribonuclease V  43.96 
 
 
239 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674348  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1457  Deoxyribonuclease V  50.48 
 
 
232 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.162733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0899  endonuclease V  45.33 
 
 
237 aa  174  1e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5432  deoxyribonuclease V  49.06 
 
 
225 aa  172  3e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1151  endonuclease V  44.74 
 
 
237 aa  172  4e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3777  deoxyribonuclease V  48.35 
 
 
199 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3125  endonuclease V  41.36 
 
 
260 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0871  Deoxyribonuclease V  41.78 
 
 
231 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3033  Deoxyribonuclease V  43.84 
 
 
234 aa  164  2e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.329103  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0460  endonuclease V  43.63 
 
 
246 aa  163  2e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0352  endonuclease V  43.63 
 
 
246 aa  163  2e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209989  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3848  endonuclease V  43.63 
 
 
234 aa  162  5e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03828  hypothetical protein  42.93 
 
 
223 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4027  endonuclease V  42.93 
 
 
223 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0184754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03875  endonuclease V  42.93 
 
 
223 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3996  Deoxyribonuclease V  42.93 
 
 
223 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4446  endonuclease V  42.93 
 
 
223 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000793274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5467  endonuclease V  42.93 
 
 
223 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581588  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0211  endonuclease V  43.5 
 
 
223 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.410173  normal  0.0295932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4489  endonuclease V  42.44 
 
 
223 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.730874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4232  endonuclease V  42.44 
 
 
223 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4541  endonuclease V  42.44 
 
 
223 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.905836  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4412  endonuclease V  41.46 
 
 
223 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4575  endonuclease V  41.46 
 
 
223 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.553382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4379  endonuclease V  41.46 
 
 
223 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.872195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4499  endonuclease V  41.46 
 
 
223 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.105241 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4501  endonuclease V  41.46 
 
 
223 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476101 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0353  Deoxyribonuclease V  43.2 
 
 
221 aa  155  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0288  endonuclease V  42.86 
 
 
228 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.247957  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0101  Deoxyribonuclease V  36.36 
 
 
226 aa  154  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  6.58544e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3866  endonuclease V  44.89 
 
 
224 aa  154  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0954  endonuclease V  40.19 
 
 
262 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.406571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0220  endonuclease V  43.01 
 
 
229 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0224  endonuclease V  43.01 
 
 
229 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1073  endonuclease V  39.72 
 
 
243 aa  151  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.646298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3712  endonuclease V  44.44 
 
 
224 aa  151  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0682  deoxyribonuclease V  44.13 
 
 
232 aa  150  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.718465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3982  Deoxyribonuclease V  41.51 
 
 
223 aa  147  1e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0350  deoxyribonuclease V  36.74 
 
 
225 aa  147  1e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.34523  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1197  Deoxyribonuclease V  44.91 
 
 
227 aa  147  1e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.159778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04762  endonuclease V  47.54 
 
 
237 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0261  deoxyribonuclease V  38.36 
 
 
234 aa  141  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.13512e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2984  Deoxyribonuclease V  44.72 
 
 
250 aa  141  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3063  deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V)  34.86 
 
 
235 aa  139  4e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3336  Deoxyribonuclease V  35.32 
 
 
232 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2452  Deoxyribonuclease V  38.5 
 
 
269 aa  127  2e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.725202  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0455  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  39.13 
 
 
303 aa  125  7e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0598  Endonuclease V  37.8 
 
 
297 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1496  Deoxyribonuclease V  33.17 
 
 
209 aa  120  2e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2631  Deoxyribonuclease V  40.2 
 
 
265 aa  119  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2966  Deoxyribonuclease V  42.42 
 
 
272 aa  118  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>