123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0035 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0035  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  100 
 
 
105 aa  217  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1632  DsrC-like protein  71.43 
 
 
105 aa  169  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3197  DsrC family protein  67.62 
 
 
105 aa  160  5e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2190  DsrC family protein  64.76 
 
 
105 aa  151  3e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0261  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  61.9 
 
 
105 aa  145  1e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0077  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  60 
 
 
105 aa  145  1e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595568 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1739  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  58.1 
 
 
105 aa  134  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4045  DsrC family protein  58.1 
 
 
105 aa  133  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000373929  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0762  dissimilatory sulfite reductase, gamma subunit  56.19 
 
 
105 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2958  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  56.19 
 
 
105 aa  129  1e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0856  DsrC family protein  53.57 
 
 
114 aa  127  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1917  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  54.29 
 
 
105 aa  125  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.512017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1196  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  53.33 
 
 
105 aa  124  4e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0534  DsrC family protein  52.38 
 
 
105 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0463  DsrC family protein  56.19 
 
 
105 aa  124  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.23057e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0910  DsrC family protein  54.46 
 
 
111 aa  123  9e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0168  DsrC family protein  54.17 
 
 
111 aa  119  2e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0347  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  54.17 
 
 
111 aa  119  2e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0220542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2480  putative sulfite reductase  50.89 
 
 
111 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.295846  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1227  DsrC family protein  51.49 
 
 
111 aa  115  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.214898  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1536  DsrC family protein  43.81 
 
 
105 aa  114  4e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1442  DsrC family protein  50.5 
 
 
111 aa  114  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.486208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1956  DsrC family protein  51.38 
 
 
110 aa  112  1e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0635  DsrC-like protein  50.56 
 
 
110 aa  112  1e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218073  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1658  DsrC family protein  52.29 
 
 
110 aa  112  2e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0048  DsrC family protein  51.33 
 
 
111 aa  108  2e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  2.43579e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2190  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  48.21 
 
 
110 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.277323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1778  DsrC-like protein  49.52 
 
 
112 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204977  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2107  DsrC family protein  45.87 
 
 
109 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  7.95282e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1805  DsrC-like protein  47.27 
 
 
112 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0038276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1858  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  46.36 
 
 
111 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000483369  normal  0.0744764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2056  formate dehydrogenase  45.71 
 
 
112 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0328837  hitchhiker  0.0003026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2132  DsrC family protein  42.86 
 
 
111 aa  96.7  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0500463  normal  0.0142953 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2007  DsrC family protein  43.81 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1957  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  46.36 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000351468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0693  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  44.55 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.13713e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2379  desulfoviridin subunit gamma  44.76 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1471  sulfur oxidation protein of DsrC family protein  42.86 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0351  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  41.9 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1800  DsrC family protein  41.82 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0554138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1969  DsrC family protein  43.81 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.70219e-05  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0035  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  43.64 
 
 
111 aa  94  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  5.08845e-08  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3037  DsrC family protein  41.9 
 
 
104 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0059771  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0127  DsrC family protein  46.36 
 
 
111 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2322  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  44.55 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2197  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  42.2 
 
 
112 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  3.04375e-08  normal  0.208546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2162  DsrC family protein  42.2 
 
 
112 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000107073  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2561  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  40.95 
 
 
104 aa  92  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.43297e-06  hitchhiker  0.0080986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2317  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  42.2 
 
 
112 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.69455e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2477  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  42.2 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  7.35989e-05  hitchhiker  9.98634e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2209  DsrC family protein  42.2 
 
 
112 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2455  DsrC-like protein  41.82 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  4.76368e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0028  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  44.25 
 
 
111 aa  90.9  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.46834  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2538  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  42.73 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.023632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1481  sulfur transfer protein TusE  40 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0185238  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2687  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  44.34 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1766  DsrC family protein  43.64 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.39637e-05  hitchhiker  0.001596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1922  DsrC-like protein  40.91 
 
 
117 aa  90.1  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.692492  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2658  DsrC -like protein  43.52 
 
 
110 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00973  predicted sulfite reductase subunit  40 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0364521  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00980  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2346  putative sulfur oxidation protein DsrC  42.16 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.691192  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0329  sulfite reductase-like protein  40.78 
 
 
109 aa  87.8  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.1498e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2847  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  42.45 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102705  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2347  sulfur transfer protein TusE  40 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1133  sulfur transfer protein TusE  40 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.74554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2674  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  40 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  9.27643e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2627  sulfur transfer protein TusE  40 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586166  hitchhiker  1.85004e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1077  sulfur transfer protein TusE  40 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00172149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1083  sulfur transfer protein TusE  40 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.9188e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2150  sulfur transfer protein TusE  40 
 
 
109 aa  87  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal  0.484844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2018  DsrC family protein  43.27 
 
 
107 aa  87  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.34118e-07  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1042  sulfur transfer protein TusE  38.1 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1159  sulfur transfer protein TusE  38.1 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.240389  normal  0.524036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1193  sulfur transfer protein TusE  38.1 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1147  sulfur transfer protein TusE  38.1 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1125  sulfur transfer protein TusE  38.1 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.84282e-21 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1522  DsrC family protein  38 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0907528  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3211  sulfurtransferase TusE  40 
 
 
109 aa  82.8  1e-15  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155098  hitchhiker  0.00231133 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2618  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  40 
 
 
109 aa  82.8  1e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2529  sulfurtransferase TusE  40 
 
 
109 aa  82.8  1e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.248983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2005  DsrC family protein  43.12 
 
 
112 aa  82.4  2e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.08488e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28150  dissimilatory sulfite reductase, DsrC-like protein  34.82 
 
 
111 aa  82.4  2e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3996  hypothetical protein  38.39 
 
 
111 aa  81.3  4e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546162  hitchhiker  0.00513548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1611  DsrC family protein  38.1 
 
 
104 aa  81.3  4e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4615  DsrC family protein  38.1 
 
 
104 aa  81.3  5e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.305747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1220  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  41.75 
 
 
109 aa  80.9  5e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1837  DsrC family protein  37.5 
 
 
111 aa  80.5  6e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00019972 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02366  hypothetical protein  41.51 
 
 
109 aa  80.9  6e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3250  DsrC family protein  40.38 
 
 
106 aa  80.5  8e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  1.20353e-05  hitchhiker  1.59534e-05 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0365  DsrC -like protein  39.62 
 
 
111 aa  79  2e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3171  DsrC-like protein  36.61 
 
 
111 aa  79  2e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169026  normal  0.259405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3400  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  37.5 
 
 
111 aa  79  2e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.340087 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0413  dissimilatory sulfite reductase, gamma subunit  37.86 
 
 
163 aa  78.2  3e-14  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0853  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  34 
 
 
104 aa  78.2  4e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.99223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003411  tRNA 2-thiouridine synthesizing protein E  38.68 
 
 
109 aa  76.6  1e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  1.75074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1705  hypothetical protein  37.27 
 
 
108 aa  74.3  4e-13  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.826446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2327  putative sulfite reductase  37.11 
 
 
111 aa  74.7  4e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02107  sulfite reductase, gamma subunit-related protein  36.19 
 
 
115 aa  74.3  5e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00973247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2600  hypothetical protein  34.51 
 
 
111 aa  73.2  1e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>