78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0033 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
254 aa  505  1e-142  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  59.29 
 
 
255 aa  291  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  49.8 
 
 
271 aa  211  8e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  48.46 
 
 
289 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  36.12 
 
 
233 aa  83.6  3e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.06057e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  31.62 
 
 
249 aa  83.2  4e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  31.65 
 
 
262 aa  80.9  2e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  32.16 
 
 
255 aa  80.5  2e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  26.03 
 
 
261 aa  70.9  2e-11  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  30.45 
 
 
244 aa  68.9  8e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  25.78 
 
 
331 aa  68.2  1e-10  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  26.52 
 
 
331 aa  65.1  1e-09  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  24.61 
 
 
331 aa  64.3  2e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  25.26 
 
 
331 aa  64.3  2e-09  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  39.05 
 
 
334 aa  63.9  2e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.57 
 
 
235 aa  63.9  2e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  26.32 
 
 
333 aa  63.5  3e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  26.77 
 
 
257 aa  63.5  3e-09  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  29.66 
 
 
335 aa  63.2  4e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  38.95 
 
 
342 aa  62.8  5e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  25.97 
 
 
330 aa  62.8  5e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  37.74 
 
 
332 aa  62.8  5e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  29.07 
 
 
337 aa  62  9e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  25.26 
 
 
331 aa  58.2  1e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  22.69 
 
 
331 aa  58.2  1e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  27.27 
 
 
330 aa  57.4  2e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.53702e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  28.98 
 
 
255 aa  56.6  3e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  39.58 
 
 
334 aa  56.6  4e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  28.57 
 
 
256 aa  56.2  5e-07  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  39.58 
 
 
339 aa  56.2  5e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0778  nitrate reductase gamma subunit  28.81 
 
 
225 aa  55.8  7e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379399  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.19 
 
 
225 aa  53.1  4e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  30.77 
 
 
248 aa  52.8  5e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.59 
 
 
233 aa  53.1  5e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1237  respiratory nitrate reductase gamma chain  26.74 
 
 
227 aa  51.2  1e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13830  respiratory nitrate reductase gamma chain  26.74 
 
 
227 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.792747  normal  0.19596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.07 
 
 
234 aa  48.9  7e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.42 
 
 
238 aa  49.3  7e-05  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  8.63008e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  35.71 
 
 
332 aa  48.9  7e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  22.94 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.57 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.57 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.48 
 
 
225 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  23.21 
 
 
220 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.22 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.06 
 
 
229 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3598  nitrite transporter  29.12 
 
 
699 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0417643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  26.28 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.25 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.09 
 
 
225 aa  45.4  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  26.38 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  25.77 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.38 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.22 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2631  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.92 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997723  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.99 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.17 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2065  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.11 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0439  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.01 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00872281  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.38 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  26.38 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.15 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  26.38 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.56 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3445  nitrate reductase, gamma subunit  27.68 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1228  nitrate reductase, gamma subunit  25.21 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0669  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.39 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0113371  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3083  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.41 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.49935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.69 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.39 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.28 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.22 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  30.09 
 
 
302 aa  42.7  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0430  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.43 
 
 
244 aa  42.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.09 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.22 
 
 
234 aa  42  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  29.63 
 
 
302 aa  42  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.862434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>