146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0031 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0031  Tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 
192 aa  383  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  38.97 
 
 
191 aa  97.8  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
193 aa  75.9  3e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0070  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
201 aa  68.2  6e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.34059e-05  normal  0.0131239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
235 aa  65.9  4e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0830  hypothetical protein  28.71 
 
 
251 aa  55.5  5e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.51764e-10  normal  0.344384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
673 aa  53.5  2e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  7.76603e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  29.03 
 
 
196 aa  52.8  3e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
200 aa  52.4  4e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
209 aa  52  6e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  40.45 
 
 
927 aa  51.6  8e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  34.62 
 
 
303 aa  50.8  1e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.7 
 
 
647 aa  50.1  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
605 aa  48.9  4e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.56395e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.74 
 
 
1838 aa  49.3  4e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
750 aa  49.3  4e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0740  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
158 aa  48.5  5e-05  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.773618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  36.96 
 
 
864 aa  48.5  6e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
187 aa  48.1  7e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
389 aa  48.1  7e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
1827 aa  48.1  7e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  33.33 
 
 
301 aa  48.1  8e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.63 
 
 
373 aa  48.1  8e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  33.67 
 
 
301 aa  48.1  8e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  35.62 
 
 
300 aa  47.8  9e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.94547e-05  hitchhiker  2.62651e-09 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
423 aa  47.8  9e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  35.62 
 
 
300 aa  47.8  9e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  35.62 
 
 
300 aa  47.8  9e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  2.87221e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  30.65 
 
 
294 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.67 
 
 
746 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  30.65 
 
 
294 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  30.65 
 
 
294 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  30.65 
 
 
294 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  34.41 
 
 
1979 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  35.62 
 
 
300 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  28.97 
 
 
299 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  31.73 
 
 
638 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  27.35 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
286 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
486 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
286 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1961  hypothetical protein  34.15 
 
 
296 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0585207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  30.77 
 
 
302 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  7.43312e-07 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
632 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.34837e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 
286 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
222 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
613 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 
645 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  6.07684e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 
929 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
597 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 
596 aa  45.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
562 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2188  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.83 
 
 
801 aa  45.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.23 
 
 
1056 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
779 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.52 
 
 
730 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  31.58 
 
 
302 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4749  hypothetical protein  32.98 
 
 
136 aa  45.1  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.495876  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 
289 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
643 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.74385e-07  hitchhiker  4.66075e-06 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 
557 aa  44.7  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1112 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  31.2 
 
 
294 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  31.2 
 
 
294 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  31.2 
 
 
294 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
301 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  31.2 
 
 
294 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  31.2 
 
 
294 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.47 
 
 
668 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.79067e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  30.67 
 
 
296 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  30.65 
 
 
294 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
1276 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
292 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  29.49 
 
 
298 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.92811e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
283 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
780 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.5 
 
 
818 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  27.93 
 
 
780 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
780 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  30.65 
 
 
294 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  30.65 
 
 
294 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
269 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  5.2453e-07  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
615 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  34.25 
 
 
300 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  4.09261e-12 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  34.25 
 
 
300 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
466 aa  42.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.37 
 
 
466 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  34.25 
 
 
300 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  31.58 
 
 
294 aa  42.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2894  hypothetical protein  35.9 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  34.25 
 
 
300 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  31.58 
 
 
294 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3603  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.09 
 
 
304 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.61 
 
 
587 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
3145 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0567  tetratricopeptide TPR_2  42 
 
 
462 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>