11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0028 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0028  hypothetical protein  100 
 
 
45 aa  90.5  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.684532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4920  hypothetical protein  59.09 
 
 
46 aa  55.5  2e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.00497e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0870  hypothetical protein  63.64 
 
 
46 aa  54.7  4e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0622  hypothetical protein  60.87 
 
 
47 aa  54.7  4e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.62546e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1787  hypothetical protein  60.47 
 
 
45 aa  51.6  3e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000484468  hitchhiker  0.00675318 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0533  hypothetical protein  59.09 
 
 
46 aa  51.6  3e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.97375e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0068  hypothetical protein  60.42 
 
 
50 aa  52  3e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  5.34426e-06  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0907  hypothetical protein  59.09 
 
 
46 aa  51.6  4e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  5.83198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3299  hypothetical protein  61.9 
 
 
55 aa  50.8  5e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  9.00607e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2207  hypothetical protein  58.7 
 
 
49 aa  47.4  6e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  6.25485e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1007  hypothetical protein  60.47 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>