33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0025 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0025  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
63 aa  124  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.917253  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0882  excisionase family DNA-binding protein  51.85 
 
 
74 aa  59.3  2e-08  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000814624  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1410  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  46 
 
 
73 aa  50.4  9e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.251698  normal  0.111999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1745  DNA binding domain protein, excisionase family  48.98 
 
 
68 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3699  hypothetical protein  40.43 
 
 
55 aa  49.3  2e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1985  DNA binding domain protein, excisionase family  42.59 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  3.0807e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  39.13 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  41.3 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  41.3 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1200  excisionase/Xis, DNA-binding  38.78 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  7.91415e-06  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  36.73 
 
 
305 aa  42.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  34.55 
 
 
315 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3698  DNA binding domain protein, excisionase family  45.83 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  32.73 
 
 
315 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  34.62 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  39.13 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  32.73 
 
 
315 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  34.62 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  34.62 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  34.62 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  32.69 
 
 
306 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  35.29 
 
 
69 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1222  hypothetical protein  48.89 
 
 
59 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.935548 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  36.21 
 
 
315 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  32.69 
 
 
306 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  32.69 
 
 
306 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  30.43 
 
 
676 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18850  DNA-binding protein, excisionase family  41.3 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0755115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  34.78 
 
 
85 aa  40  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  38.18 
 
 
308 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>