24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0023 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  100 
 
 
576 aa  1165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  39.74 
 
 
650 aa  328  2e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  45.52 
 
 
521 aa  325  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  34.86 
 
 
535 aa  272  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  32.51 
 
 
866 aa  249  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  33.19 
 
 
739 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  35.97 
 
 
643 aa  239  8e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  32.38 
 
 
572 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  34.93 
 
 
701 aa  223  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  35.06 
 
 
399 aa  215  2e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  34.69 
 
 
685 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  33.73 
 
 
880 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  33.4 
 
 
545 aa  198  2e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  31.37 
 
 
636 aa  196  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  28.48 
 
 
746 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  32.83 
 
 
427 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  33.33 
 
 
377 aa  175  2e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  29.39 
 
 
525 aa  174  3e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  34.75 
 
 
317 aa  143  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  24.33 
 
 
1027 aa  64.7  4e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0907  Zn-finger, CHC2 type  23.01 
 
 
1098 aa  61.2  5e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  41.18 
 
 
272 aa  47  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3790  DNA primase catalytic core  21.31 
 
 
1103 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443954  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1921  DNA primase-like  21.31 
 
 
1103 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>