More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0012 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  100 
 
 
383 aa  776  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  47.66 
 
 
381 aa  353  3e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.65595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  42.37 
 
 
370 aa  285  9e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  38.93 
 
 
369 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  38.67 
 
 
369 aa  254  2e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  1.20563e-05 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  39.18 
 
 
385 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  37.33 
 
 
369 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  40.06 
 
 
390 aa  247  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  36.75 
 
 
370 aa  246  7e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  37.24 
 
 
374 aa  244  2e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  39.25 
 
 
368 aa  244  2e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  37.24 
 
 
374 aa  244  2e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  37.76 
 
 
435 aa  241  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  38.25 
 
 
383 aa  239  7e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  36.81 
 
 
392 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  38.92 
 
 
378 aa  236  7e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  37.4 
 
 
386 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  34.55 
 
 
373 aa  222  9e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  36.03 
 
 
400 aa  214  2e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  34.48 
 
 
388 aa  212  8e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  38.81 
 
 
414 aa  204  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  34.34 
 
 
463 aa  202  1e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  35.73 
 
 
392 aa  202  1e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  34.11 
 
 
387 aa  198  1e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  37.7 
 
 
370 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  36.94 
 
 
378 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  36.05 
 
 
377 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  39.86 
 
 
305 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  32.69 
 
 
363 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  35.26 
 
 
409 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  36.6 
 
 
377 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  33.33 
 
 
391 aa  189  6e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  31.87 
 
 
391 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  35.29 
 
 
379 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  35.28 
 
 
391 aa  179  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  33.05 
 
 
477 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  35.53 
 
 
379 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  35.53 
 
 
379 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  31.54 
 
 
386 aa  175  1e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  32.16 
 
 
376 aa  174  2e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  30.95 
 
 
389 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  34.06 
 
 
325 aa  164  2e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  32.11 
 
 
403 aa  162  8e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  30 
 
 
413 aa  160  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  30.16 
 
 
381 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  29.89 
 
 
381 aa  147  2e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  27.56 
 
 
442 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  30.6 
 
 
443 aa  142  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  31.23 
 
 
357 aa  140  4e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  31.09 
 
 
404 aa  139  8e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.02 
 
 
376 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.02 
 
 
376 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  29.02 
 
 
443 aa  134  2e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  30.62 
 
 
374 aa  134  2e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  31.4 
 
 
402 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  26.65 
 
 
393 aa  131  2e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  30.89 
 
 
422 aa  131  2e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  32.48 
 
 
398 aa  130  4e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  7.33221e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  30.19 
 
 
426 aa  128  1e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  30.38 
 
 
431 aa  126  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  30.9 
 
 
367 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.52 
 
 
376 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  29.58 
 
 
422 aa  123  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  28.5 
 
 
416 aa  123  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  29.5 
 
 
451 aa  122  1e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  27.89 
 
 
378 aa  121  2e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.74 
 
 
376 aa  120  5e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  29.18 
 
 
371 aa  119  1e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  31.46 
 
 
487 aa  119  1e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.28 
 
 
416 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  27.45 
 
 
384 aa  116  7e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  27.18 
 
 
308 aa  114  2e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  27.75 
 
 
409 aa  114  2e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  30.35 
 
 
377 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  29.69 
 
 
506 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.91844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  26.28 
 
 
398 aa  112  8e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  30.64 
 
 
492 aa  112  8e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  34.38 
 
 
471 aa  111  2e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  34.38 
 
 
471 aa  111  2e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  27.15 
 
 
362 aa  110  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  28.45 
 
 
656 aa  109  9e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.95 
 
 
388 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  31.41 
 
 
385 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  26.88 
 
 
407 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  28.21 
 
 
494 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  32.49 
 
 
397 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  28.99 
 
 
380 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.65 
 
 
387 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  26.5 
 
 
391 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  23.5 
 
 
376 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.13824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.15 
 
 
365 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  27.67 
 
 
407 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  26.9 
 
 
404 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  27.43 
 
 
370 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  27.33 
 
 
345 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  27.33 
 
 
345 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  28.03 
 
 
407 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  25.58 
 
 
399 aa  101  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  36.84 
 
 
201 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2947  DNA integration/recombination/invertion protein  36.54 
 
 
177 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>