More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0011 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
427 aa  865  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  67.14 
 
 
424 aa  604  1e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  69.27 
 
 
425 aa  590  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  67.61 
 
 
427 aa  583  1e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  2.14163e-06 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  65.72 
 
 
424 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.07933e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  67.14 
 
 
424 aa  572  1e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  63.36 
 
 
423 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  63.21 
 
 
423 aa  555  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  63.16 
 
 
422 aa  555  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  62.71 
 
 
424 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  62.71 
 
 
424 aa  552  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  62.47 
 
 
424 aa  551  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.49119e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  62.71 
 
 
424 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  62.71 
 
 
424 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.51386e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  62.47 
 
 
424 aa  551  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  62.71 
 
 
424 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.12252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  64.75 
 
 
423 aa  551  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  3.46844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  62.71 
 
 
424 aa  552  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  62.71 
 
 
424 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.83486e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  63.64 
 
 
420 aa  548  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  62.23 
 
 
424 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  62.95 
 
 
424 aa  548  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.27784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  62.29 
 
 
425 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  63.64 
 
 
421 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  62.29 
 
 
425 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  60.52 
 
 
427 aa  537  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  59.81 
 
 
426 aa  534  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  63.59 
 
 
423 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  61.88 
 
 
422 aa  528  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  59.15 
 
 
425 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  61.88 
 
 
422 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55791e-12 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 
422 aa  525  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  60 
 
 
424 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 
422 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.36944e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
422 aa  516  1e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  58.59 
 
 
424 aa  517  1e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 
423 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  59.1 
 
 
426 aa  512  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.08686e-07  hitchhiker  6.59657e-08 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
425 aa  509  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  58.14 
 
 
432 aa  505  1e-142  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  57.92 
 
 
422 aa  503  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.1419e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  57.41 
 
 
427 aa  502  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
423 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  58.03 
 
 
425 aa  501  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  55.79 
 
 
422 aa  495  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
427 aa  497  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  55.32 
 
 
423 aa  494  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  56.03 
 
 
425 aa  493  1e-138  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
428 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  55.08 
 
 
428 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  55.08 
 
 
428 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
423 aa  488  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  54.59 
 
 
425 aa  486  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  57.75 
 
 
425 aa  485  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
423 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  56.67 
 
 
427 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  55.9 
 
 
423 aa  483  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  53.95 
 
 
430 aa  478  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
428 aa  477  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  54.52 
 
 
426 aa  477  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
424 aa  475  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
424 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
427 aa  473  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  57.51 
 
 
425 aa  473  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 
427 aa  470  1e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
424 aa  470  1e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
424 aa  466  1e-130  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
417 aa  462  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 
435 aa  463  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.7376e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
428 aa  459  1e-128  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.21115e-07  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  53.4 
 
 
425 aa  459  1e-128  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
429 aa  460  1e-128  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
426 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  54.35 
 
 
427 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  54.59 
 
 
469 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
427 aa  455  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  53.19 
 
 
424 aa  452  1e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
428 aa  452  1e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
428 aa  452  1e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
428 aa  451  1e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.08788e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
428 aa  454  1e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
428 aa  452  1e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
430 aa  452  1e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1426  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 
426 aa  451  1e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0522014  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
428 aa  451  1e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.45216e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  53.02 
 
 
428 aa  454  1e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  54.86 
 
 
431 aa  452  1e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
428 aa  452  1e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  51.87 
 
 
428 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
428 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  54.59 
 
 
442 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
426 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  51.62 
 
 
428 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.18192e-05  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
428 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
421 aa  447  1e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  5.82933e-05 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
421 aa  447  1e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
426 aa  446  1e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
424 aa  445  1e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
434 aa  445  1e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
426 aa  447  1e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>