More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0009 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  100 
 
 
383 aa  759  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  60.58 
 
 
384 aa  455  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.96245e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  54.5 
 
 
385 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  52.38 
 
 
382 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  46.86 
 
 
383 aa  359  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  47.4 
 
 
400 aa  354  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  50 
 
 
385 aa  352  9e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  44.59 
 
 
384 aa  342  6e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.26602e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  46.7 
 
 
384 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  8.31703e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  47.4 
 
 
385 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  45.69 
 
 
388 aa  337  2e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.22298e-05  hitchhiker  1.85369e-06 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  46.44 
 
 
384 aa  337  2e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  46.05 
 
 
360 aa  334  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  44.79 
 
 
384 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  45.29 
 
 
382 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  45.29 
 
 
382 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  46.17 
 
 
382 aa  327  2e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  44.85 
 
 
362 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  44.57 
 
 
362 aa  325  8e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  44.57 
 
 
362 aa  325  9e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  42.25 
 
 
381 aa  321  1e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  46.05 
 
 
386 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  41.34 
 
 
386 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  8.96436e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  43.57 
 
 
383 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  43.19 
 
 
382 aa  315  1e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  41.8 
 
 
379 aa  314  2e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  42.82 
 
 
379 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  38.96 
 
 
384 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  38.96 
 
 
384 aa  310  3e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  39.84 
 
 
385 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  43.24 
 
 
379 aa  308  8e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.12673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  42.97 
 
 
379 aa  308  1e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  42.82 
 
 
397 aa  307  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  44.19 
 
 
363 aa  306  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  43.57 
 
 
383 aa  305  8e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  42.86 
 
 
380 aa  305  1e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  41.62 
 
 
382 aa  303  4e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  43.05 
 
 
382 aa  301  9e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  42.67 
 
 
380 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  41.84 
 
 
382 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  41.21 
 
 
382 aa  299  5e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  40.34 
 
 
387 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  40.68 
 
 
382 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  43.68 
 
 
379 aa  296  4e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  41.64 
 
 
382 aa  295  7e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.68 
 
 
382 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  41.27 
 
 
380 aa  294  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  41.95 
 
 
387 aa  294  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  38.86 
 
 
387 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  39.45 
 
 
387 aa  289  5e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  38.94 
 
 
387 aa  286  6e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  38.73 
 
 
385 aa  285  1e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  38.73 
 
 
385 aa  285  1e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  42.42 
 
 
395 aa  284  2e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  41.96 
 
 
395 aa  277  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  40.89 
 
 
387 aa  276  4e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  44.47 
 
 
381 aa  271  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.63 
 
 
380 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  42.27 
 
 
389 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  44.39 
 
 
376 aa  267  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  38.95 
 
 
387 aa  266  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  38.48 
 
 
391 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  40.05 
 
 
396 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  37.96 
 
 
391 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  39.37 
 
 
396 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  40.58 
 
 
375 aa  259  5e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  39.11 
 
 
398 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  41.24 
 
 
391 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  41.19 
 
 
377 aa  257  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  40.21 
 
 
415 aa  255  1e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  42.41 
 
 
376 aa  254  2e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  40.16 
 
 
396 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  38.9 
 
 
406 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.31297e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  38.64 
 
 
406 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  40.05 
 
 
398 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  39.58 
 
 
396 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  38.9 
 
 
406 aa  246  5e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  37.57 
 
 
415 aa  246  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  37.86 
 
 
401 aa  245  7e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  36.48 
 
 
394 aa  245  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  38.26 
 
 
399 aa  245  1e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  40.74 
 
 
402 aa  244  2e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  41.4 
 
 
391 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  37.43 
 
 
381 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  41.9 
 
 
391 aa  243  4e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  38.64 
 
 
417 aa  243  4e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  40.33 
 
 
394 aa  242  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  38.2 
 
 
406 aa  243  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  37.07 
 
 
413 aa  242  8e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  39.68 
 
 
421 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  41.4 
 
 
391 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  38.12 
 
 
417 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  38.3 
 
 
396 aa  240  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  37.43 
 
 
406 aa  239  6e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  40.53 
 
 
401 aa  239  6e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  4.40044e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  38.58 
 
 
395 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  38.23 
 
 
406 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  36.2 
 
 
414 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  36.31 
 
 
403 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  36.98 
 
 
396 aa  235  8e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.894708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>