180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0008 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0008  SNO glutamine amidotransferase  100 
 
 
194 aa  381  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.36 
 
 
191 aa  233  1e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000714565  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  63.64 
 
 
189 aa  233  1e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  5.32264e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  60.43 
 
 
188 aa  229  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  2.00223e-14  unclonable  6.68451e-09 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0448  glutamine amidotransferase subunit PdxT  55.08 
 
 
188 aa  229  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000803094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0463  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.55 
 
 
188 aa  227  9e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  56.15 
 
 
188 aa  224  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0013  SNO glutamine amidotransferase  54.59 
 
 
193 aa  216  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489468  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1897  SNO glutamine amidotransferase  56.59 
 
 
191 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0960589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3807  SNO glutamine amidotransferase  61.17 
 
 
190 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00155051  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1858  glutamine amidotransferase subunit PdxT  53.48 
 
 
187 aa  209  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0468928  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1317  SNO glutamine amidotransferase  55.73 
 
 
204 aa  204  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522409  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0573  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.79 
 
 
195 aa  201  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0035  SNO glutamine amidotransferase  51.61 
 
 
196 aa  201  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2107  SNO glutamine amidotransferase  54.08 
 
 
219 aa  201  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0846545  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1367  glutamine amidotransferase subunit PdxT  56.38 
 
 
199 aa  200  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  51.58 
 
 
192 aa  200  1e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.28055e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1037  glutamine amidotransferase  52.94 
 
 
191 aa  199  2e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3235  SNO glutamine amidotransferase  55.61 
 
 
189 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0598  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.79 
 
 
195 aa  198  4e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.474532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  52.11 
 
 
196 aa  198  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1483  SNO glutamine amidotransferase  51.58 
 
 
190 aa  197  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.441099  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1110  SNO glutamine amidotransferase  54.79 
 
 
198 aa  197  8e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00211024  hitchhiker  1.81394e-14 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2566  glutamine amidotransferase subunit PdxT  55.73 
 
 
195 aa  197  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_538  SNO glutamine amidotransferase family  54.26 
 
 
195 aa  194  6e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5148  glutamine amidotransferase subunit PdxT  55.85 
 
 
203 aa  194  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00302911  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6117  SNO glutamine amidotransferase family  55.03 
 
 
196 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298038  normal  0.336811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2250  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.4 
 
 
206 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2240  SNO glutamine amidotransferase  48.11 
 
 
189 aa  193  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0214455  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2297  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.4 
 
 
206 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3723  SNO glutamine amidotransferase  54.26 
 
 
189 aa  193  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1988  SNO glutamine amidotransferase  55.44 
 
 
200 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1930  SNO glutamine amidotransferase  52.04 
 
 
201 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142807  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2041  SNO glutamine amidotransferase  55.61 
 
 
190 aa  190  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0223517  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1750  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.06 
 
 
191 aa  190  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2289  glutamine amidotransferase subunit PdxT  53.89 
 
 
206 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1547  SNO glutamine amidotransferase  52.94 
 
 
195 aa  190  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  hitchhiker  0.00674426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.53 
 
 
196 aa  190  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.53 
 
 
196 aa  189  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.89315e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.53 
 
 
196 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.49279e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5303  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.53 
 
 
196 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.78442e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2109  SNO glutamine amidotransferase  52.76 
 
 
204 aa  189  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0561786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2937  SNO glutamine amidotransferase  50.79 
 
 
190 aa  189  3e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  0.214935 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.53 
 
 
196 aa  189  3e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000426828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  51.05 
 
 
196 aa  189  3e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000439429  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3399  SNO glutamine amidotransferase  53.97 
 
 
203 aa  188  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144938  hitchhiker  8.92885e-06 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2382  SNO glutamine amidotransferase  53.61 
 
 
201 aa  187  6e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1664  SNO glutamine amidotransferase  50 
 
 
213 aa  187  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0590929  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1107  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.5 
 
 
201 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00213413  decreased coverage  0.0014311 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0959  SNO glutamine amidotransferase  48.94 
 
 
192 aa  186  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2067  SNO glutamine amidotransferase  52.82 
 
 
196 aa  183  1e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.42 
 
 
196 aa  184  1e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00056794  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0040  SNO glutamine amidotransferase  54.21 
 
 
196 aa  182  2e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3180  SNO glutamine amidotransferase  50.52 
 
 
217 aa  182  2e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3058  SNO glutamine amidotransferase  53.09 
 
 
207 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293498  normal  0.634434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3830  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.45 
 
 
195 aa  181  4e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12623  glutamine amidotransferase subunit PdxT  53.09 
 
 
198 aa  182  4e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0824  SNO glutamine amidotransferase  48.48 
 
 
202 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589495  normal  0.0695207 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  53.09 
 
 
207 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.550615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1792  SNO glutamine amidotransferase  52.82 
 
 
203 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.369392  normal  0.171036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1778  SNO glutamine amidotransferase  51.28 
 
 
201 aa  178  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2184  SNO glutamine amidotransferase  43.92 
 
 
188 aa  178  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  8.61553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1791  SNO glutamine amidotransferase  50.77 
 
 
201 aa  178  5e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16453  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15360  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  47.37 
 
 
212 aa  178  6e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132239  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.53 
 
 
196 aa  177  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.39131e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.53 
 
 
196 aa  177  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2350  SNO glutamine amidotransferase  47.96 
 
 
204 aa  176  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0014  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50 
 
 
196 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2298  SNO glutamine amidotransferase  48.74 
 
 
211 aa  176  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50 
 
 
196 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000347383  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2305  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.66 
 
 
236 aa  175  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00618121  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0159  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.03 
 
 
186 aa  174  8e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2628  SNO glutamine amidotransferase  48.21 
 
 
210 aa  173  1e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556247  normal  0.566633 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0422  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.67 
 
 
198 aa  172  2e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1871  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.27 
 
 
192 aa  172  2e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156111  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0920  SNO glutamine amidotransferase  49.46 
 
 
186 aa  172  2e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0078  hypothetical protein  49.74 
 
 
189 aa  171  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0431149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1859  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.39 
 
 
189 aa  171  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00060363  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2097  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50 
 
 
201 aa  170  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0556  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.56 
 
 
186 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2035  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.79 
 
 
236 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03921e-10 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0542  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.56 
 
 
186 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3580  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.22 
 
 
200 aa  167  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.118248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3161  SNO glutamine amidotransferase  49.47 
 
 
191 aa  167  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655935  normal  0.065831 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0902  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.11 
 
 
212 aa  167  9e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19920  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  44.88 
 
 
208 aa  164  6e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.573466  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1060  pyridoxal 5'-phosphate synthase, glutaminase subunit Pdx2  44.57 
 
 
197 aa  161  5e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.149673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2323  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.74 
 
 
196 aa  159  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0551  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.3 
 
 
197 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1908  SNO glutamine amidotransferase  41.18 
 
 
188 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1220  SNO glutamine amidotransferase  47.09 
 
 
212 aa  155  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1078  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.92 
 
 
199 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.85984e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1478  SNO glutamine amidotransferase  40 
 
 
205 aa  154  5e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.48 
 
 
195 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0367546 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3479  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.68 
 
 
195 aa  152  3e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.31232  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1638  SNO glutamine amidotransferase  40.4 
 
 
200 aa  152  3e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1439  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.41 
 
 
186 aa  149  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0468  SNO glutamine amidotransferase  40.93 
 
 
192 aa  149  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.95 
 
 
192 aa  149  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1601  SNO glutamine amidotransferase  39.69 
 
 
198 aa  146  1e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>