More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0006 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  53.8 
 
 
823 aa  908  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2512  DNA gyrase subunit A  49.46 
 
 
878 aa  824  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0982635 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2457  DNA gyrase subunit A  49.46 
 
 
878 aa  824  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0910619  normal  0.208896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  48.11 
 
 
904 aa  777  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0096  DNA gyrase, A subunit  51.88 
 
 
827 aa  845  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180112  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  50.5 
 
 
826 aa  829  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  46.05 
 
 
913 aa  748  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  49.5 
 
 
828 aa  825  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  5.07659e-05  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  50.62 
 
 
816 aa  842  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1431  DNA gyrase subunit A  47.39 
 
 
883 aa  754  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  51.27 
 
 
848 aa  857  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  52.12 
 
 
828 aa  868  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  9.29696e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5084  DNA gyrase, A subunit  46.18 
 
 
908 aa  761  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615317  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  57.21 
 
 
807 aa  980  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00734  DNA gyrase subunit A  46.83 
 
 
898 aa  751  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.942934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0771  DNA gyrase subunit A  48.59 
 
 
889 aa  812  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.380841  hitchhiker  0.00768544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3009  DNA gyrase subunit A  48.75 
 
 
878 aa  812  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.354996  normal  0.0330044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2498  DNA gyrase subunit A  49.34 
 
 
878 aa  821  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4482  DNA gyrase, A subunit  51.14 
 
 
906 aa  811  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  54.11 
 
 
836 aa  897  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  49.75 
 
 
812 aa  798  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0894  DNA gyrase, A subunit  48.79 
 
 
845 aa  810  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5027  DNA gyrase, A subunit  46.19 
 
 
911 aa  757  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.0567458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  50.06 
 
 
853 aa  820  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  49.82 
 
 
857 aa  806  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  53.8 
 
 
823 aa  905  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  45.78 
 
 
927 aa  748  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2058  DNA gyrase, A subunit  48.13 
 
 
916 aa  796  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000369381  unclonable  6.93229e-12 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3041  DNA gyrase subunit A  48.8 
 
 
883 aa  812  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.894078  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  50.88 
 
 
808 aa  844  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  53.55 
 
 
823 aa  902  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3365  DNA gyrase subunit A  49.82 
 
 
875 aa  824  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.329132  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1767  DNA gyrase subunit A  49.46 
 
 
885 aa  827  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1016  DNA gyrase, A subunit  48.79 
 
 
845 aa  810  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  9.44183e-11 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2616  DNA gyrase subunit A  49.46 
 
 
878 aa  824  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.341614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2408  DNA gyrase subunit A  49.46 
 
 
878 aa  824  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000367831  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2606  DNA gyrase subunit A  49.82 
 
 
875 aa  823  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  49.14 
 
 
840 aa  809  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  9.48225e-06 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0738  DNA gyrase subunit A  49.22 
 
 
859 aa  808  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.958835  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0638  DNA gyrase, A subunit  51.15 
 
 
848 aa  834  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00668409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2264  DNA gyrase subunit A  48.05 
 
 
867 aa  806  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4719  DNA gyrase subunit A  48.3 
 
 
888 aa  790  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.902316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  51.36 
 
 
899 aa  848  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2404  DNA gyrase, A subunit  48.24 
 
 
916 aa  798  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00637691  unclonable  1.91603e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  50.06 
 
 
827 aa  791  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  45.94 
 
 
913 aa  750  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  51.44 
 
 
830 aa  829  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.24756e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  48.7 
 
 
837 aa  765  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2067  DNA gyrase, A subunit  49.12 
 
 
903 aa  810  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  49.94 
 
 
882 aa  826  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.3 
 
 
904 aa  801  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.55743e-05 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0843  DNA gyrase subunit A  49.76 
 
 
873 aa  796  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.462106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2526  DNA gyrase subunit A  49.82 
 
 
875 aa  823  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2371  DNA gyrase subunit A  49.82 
 
 
875 aa  824  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02730  DNA gyrase subunit A  50.12 
 
 
878 aa  844  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1310  DNA gyrase subunit A  50.78 
 
 
885 aa  832  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0388177  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4567  DNA gyrase, A subunit  46.19 
 
 
911 aa  757  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  53.69 
 
 
823 aa  902  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  47.87 
 
 
893 aa  782  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0920  DNA gyrase subunit A  48.58 
 
 
867 aa  807  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0820357 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1315  DNA gyrase subunit A  46 
 
 
902 aa  765  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  8.57491e-07  decreased coverage  3.46296e-25 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0959  DNA gyrase subunit A  48.47 
 
 
885 aa  794  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2123  DNA gyrase subunit A  47.87 
 
 
893 aa  782  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4447  DNA gyrase, A subunit  46.61 
 
 
914 aa  762  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.950017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0999  DNA gyrase subunit A  48.56 
 
 
851 aa  796  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2306  DNA gyrase, A subunit  48.54 
 
 
905 aa  806  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0379216  hitchhiker  1.00846e-06 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2151  DNA gyrase, A subunit  46.59 
 
 
910 aa  761  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587258  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1374  DNA gyrase subunit A  47.33 
 
 
923 aa  805  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2379  DNA gyrase subunit A  49.7 
 
 
875 aa  821  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.076856  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1420  DNA gyrase subunit A  49.7 
 
 
875 aa  820  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  4.67679e-06 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2846  DNA gyrase subunit A  50.78 
 
 
897 aa  832  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  62.41 
 
 
812 aa  1022  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  8.00696e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1358  DNA gyrase subunit A  48.01 
 
 
921 aa  816  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.832857  normal  0.422434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  56.21 
 
 
807 aa  939  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  50.69 
 
 
823 aa  778  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  48 
 
 
869 aa  802  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  47 
 
 
870 aa  751  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0323  DNA gyrase, A subunit  50.69 
 
 
846 aa  777  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0007  DNA gyrase, A subunit  49.94 
 
 
839 aa  762  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  50.6 
 
 
853 aa  846  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003111  DNA gyrase subunit A  49.59 
 
 
906 aa  843  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00046231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  48.19 
 
 
827 aa  773  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4476  DNA gyrase, A subunit  50.24 
 
 
891 aa  811  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1339  DNA gyrase, A subunit  49.58 
 
 
864 aa  820  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0126105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3211  DNA gyrase subunit A  49.34 
 
 
879 aa  822  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  55.74 
 
 
818 aa  922  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  100 
 
 
802 aa  1596  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  50.5 
 
 
809 aa  816  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  55.38 
 
 
811 aa  941  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  55.22 
 
 
820 aa  919  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  53.55 
 
 
932 aa  878  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  52.43 
 
 
901 aa  883  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  52.12 
 
 
819 aa  855  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  50.75 
 
 
816 aa  779  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  53.61 
 
 
809 aa  858  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11138  DNA gyrase A subunit  47.28 
 
 
848 aa  810  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2474  DNA gyrase, A subunit  53.88 
 
 
805 aa  847  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  1.72995e-05  decreased coverage  0.00702489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  50 
 
 
834 aa  765  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0010  DNA gyrase, A subunit  48.45 
 
 
837 aa  759  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2151  DNA gyrase, A subunit  48.01 
 
 
834 aa  762  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.86517e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>