More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3608 on replicon NC_009471
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  100 
 
 
469 aa  925    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  65.34 
 
 
459 aa  604  1.0000000000000001e-171  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  53.28 
 
 
477 aa  472  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  46.07 
 
 
465 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  46.01 
 
 
443 aa  359  6e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  46.01 
 
 
441 aa  358  9e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  42.52 
 
 
442 aa  332  9e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  42.52 
 
 
442 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  41.48 
 
 
467 aa  327  3e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  40.61 
 
 
458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  39.24 
 
 
471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  32.93 
 
 
555 aa  228  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  34 
 
 
555 aa  225  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  32.91 
 
 
476 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  31.39 
 
 
458 aa  196  6e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  32.52 
 
 
460 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  34.97 
 
 
442 aa  196  9e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  31.7 
 
 
427 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  33.09 
 
 
465 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
465 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
423 aa  176  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  32.96 
 
 
456 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  33.63 
 
 
471 aa  173  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  28.88 
 
 
451 aa  170  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39515  predicted protein  31.16 
 
 
623 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  30.13 
 
 
458 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  30.13 
 
 
458 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  29.52 
 
 
446 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  28.29 
 
 
452 aa  154  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.79 
 
 
447 aa  153  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  27.48 
 
 
464 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  29.1 
 
 
499 aa  151  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  26.07 
 
 
443 aa  150  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  26.74 
 
 
468 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  26.74 
 
 
468 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  26.52 
 
 
468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  25.95 
 
 
445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  26.52 
 
 
468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  25.84 
 
 
443 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  26.52 
 
 
468 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  25.84 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  25.84 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  25.84 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  25.84 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  25.84 
 
 
443 aa  147  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  26.35 
 
 
452 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  28.32 
 
 
463 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  31.02 
 
 
454 aa  144  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  27.77 
 
 
473 aa  143  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  29.78 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  30.75 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
508 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46692  predicted protein  29.03 
 
 
566 aa  140  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01210  Pi-transporter A-1, putative  28.42 
 
 
729 aa  139  7.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.02 
 
 
474 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
451 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  25.17 
 
 
438 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17265  predicted protein  28.34 
 
 
663 aa  136  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.69 
 
 
472 aa  136  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  26.36 
 
 
476 aa  133  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  29.02 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  26.73 
 
 
471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.09 
 
 
474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.83 
 
 
473 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 
404 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.09 
 
 
474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.55 
 
 
474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
451 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  26.74 
 
 
485 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  28.38 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.58 
 
 
438 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  25.6 
 
 
458 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  28.1 
 
 
457 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  28.61 
 
 
526 aa  126  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.67 
 
 
457 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  29.13 
 
 
399 aa  126  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05935  MFS phosphate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10690)  27.51 
 
 
663 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
445 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
450 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  27.14 
 
 
467 aa  126  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50547  glycerophosphoinositol permease  28.05 
 
 
530 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  27.19 
 
 
478 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  27.41 
 
 
478 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27.79 
 
 
438 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
447 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  27.19 
 
 
478 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  27.19 
 
 
478 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  27.08 
 
 
480 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  27.19 
 
 
478 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  27.19 
 
 
478 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
435 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.55 
 
 
455 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.72 
 
 
399 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  26.97 
 
 
478 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  26.91 
 
 
477 aa  124  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>